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基于主元分析与近邻距离的特征基因选择与去噪
引用本文:吕江婷,陈少斌,黄宴委. 基于主元分析与近邻距离的特征基因选择与去噪[J]. 福州大学学报(自然科学版), 2013, 41(1): 49-52
作者姓名:吕江婷  陈少斌  黄宴委
作者单位:福州大学电气工程与自动化学院,福建 福州 350116
基金项目:教育部博士点新教师基金资助项目(20113514120007);福建省自然科学基金资助项目(2010J05132);福建省教育厅科研资助项目(JA10034)
摘    要:针对高维小样本大噪声的基因芯片数据,提出一种基于主元分析与k-近邻距离的特征基因选择与去噪方法.首先利用主元分析法获取低维投影空间中的模式特征,依据各个基因贡献率大小排序,选择贡献率大的基因为特征基因,进而利用k-近邻距离来消除野值噪声以获得稳定高效的分类精度.实验结果表明:提出的特征基因选择与去噪方法,使得特征基因分类精度更高、性能更稳定.

关 键 词:基因表达谱  特征基因选择  主元分析  k-近邻  去噪

Gene selection and noise reduction based on PCA and nearest neighbors distance
LU Jiang-ting,CHEN Shao-bin,HUANG Yan-wei. Gene selection and noise reduction based on PCA and nearest neighbors distance[J]. Journal of Fuzhou University(Natural Science Edition), 2013, 41(1): 49-52
Authors:LU Jiang-ting  CHEN Shao-bin  HUANG Yan-wei
Affiliation:College of Electrical Engineering and Automation Fuzhan, Fujian 350116, China
Abstract:
Keywords:microarray gene expression   feature gene selection   PCA   k-nearest neighbor   noise reduction
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