| 需氧恶性杆菌和海栖热袍菌基因组中第一ATG规则的检验 |
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| 引用本文： | 胡秀珍,李宏,吕军.需氧恶性杆菌和海栖热袍菌基因组中第一ATG规则的检验[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2002,33(6). |
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| 作者姓名： | 胡秀珍 李宏 吕军 |
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| 作者单位： | 1. 内蒙古工业大学基础部,内蒙古,呼和浩特,010062
2. 内蒙古大学理论生物物理研究室,内蒙古,呼和浩特,010021 |
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| 基金项目： | 内蒙古自治区自然科学基金资助项目(20001301) |
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| 摘 要： | 将第一ATG规则用于需氧恶性杆菌(A.pernix)和海栖热袍菌(T.maritima)两类细菌基因组中,用已知的ORF(包含已知基因编码区)进行检验,其结果对以ATG起始的ORF序列,正确率分别为100%,89.9%;并对两种细菌基因组中L-Ter到第一ATG之间的距离作了相应的统计分析,结果表明:非ATG起始的ORF中,L-Ter到第一ATG之间的平均距离是以ATG起始的4至5倍,很可能是非ATG起始的ORF的一个重要序列特征;分析了两种细菌终止密码子在L-Ter和Ter中的使用频率,发现在Ter中终止密码子使用的偏置程度比在L-Ter中大.
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| 关 键 词： | 第一ATG规则 起始密码子 终止密码子 细菌基因组 |
A Check on the First ATG rule of ORF Start Codons of A. Pernix and T. maritime genomes |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | the First ATG rule start codon terminal codon bacterial genome |
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