基于转录组的福鼎大白茶叶片两种发育阶段的苯丙烷代谢合成途径分析比较 |
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作者单位: | 贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室,贵州贵阳 550001 |
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摘 要: | 以福鼎大白茶一芽一叶时的第一片嫩叶组织与一芽四叶时的第四片成熟叶组织转录组测序数据为研究对象,利用转录组技术筛选两种发育阶段的差异表达基因。将原始reads与参考基因组进行序列比对,各样品平均比对率为86.16%。将比对到参考基因组上的reads数据标准化并得到样品的FPKM值。相对于成熟叶,嫩叶有1 097个基因上调,1 436个基因下调;通过KEGG代谢通路分析,得到2种叶片中参与苯丙烷代谢途径关键基因的差异,为进一步研究福鼎大白茶苯丙烷代谢合成途径提供理论依据。
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关 键 词: | 茶 转录组 差异表达基因 苯丙烷代谢 |
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