| 改进的非齐性空间反应扩散主方程的随机模拟 |
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| 引用本文： | 刘祥,周文,闫正楼,王翼飞.改进的非齐性空间反应扩散主方程的随机模拟[J].应用科学学报,2007,25(6):651-656. |
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| 作者姓名： | 刘祥 周文 闫正楼 王翼飞 |
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| 作者单位： | 上海大学 数学系，上海 200444 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家高技术研究发展计划(863计划) |
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| 摘 要： | 提出一种改进的下一子空间算法,与原先的下一子空间算法相比，可以模拟更为复杂空间结构中的生化反应，并在某些情况下还可以降低计算量。该文以一个生化反应系统为例，分别利用原始的下一子空间算法和该文的改进算法进行了模拟。结果表明，在某些条件下该文提出的改进算法可以明显地减少模拟所需的计算量。
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| 关 键 词： | 基因调控网络 反应扩散方程 Gillespie算法 下一子空间方法 |
| 文章编号： | 0255-8297（2007）06-0651-06 |
| 收稿时间： | 2007-05-23 |
| 修稿时间： | 2007-05-23 |
Improved Algorithm for Stochastic Simulation of Reaction-Diffusive Master Equation in Inhomogeneous Space |
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| LIU Xiang,ZHOU Wen,YAN Zheng-lou,WANG Yi-fei.Improved Algorithm for Stochastic Simulation of Reaction-Diffusive Master Equation in Inhomogeneous Space[J].Journal of Applied Sciences,2007,25(6):651-656. |
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| Authors: | LIU Xiang ZHOU Wen YAN Zheng-lou WANG Yi-fei |
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| Institution: | Department of Mathematics, Shanghai University, Shanghai 200444 |
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| Abstract: | We proposed an improved next subvolume method in this paper.Numerical results show that the proposed method can be applied to biochemical reactions systems with complex spatial structure,indicating significant improvement in efficiency compared to existing approaches under some conditions. |
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| Keywords: | gene regulatory network reaction-diffusion master equation Gillespie algorithm the next subvolume method |
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