| 一种面向基因与疾病关系的文本挖掘方法 |
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| 引用本文： | 龚乐君,韦有兵,谢建明,袁志栋,孙啸. 一种面向基因与疾病关系的文本挖掘方法[J]. 东南大学学报(自然科学版), 2010, 40(3). DOI: 10.3969/j.issn.1001-0505.2010.03.010 |
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| 作者姓名： | 龚乐君 韦有兵 谢建明 袁志栋 孙啸 |
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| 作者单位： | 东南大学生物电子学国家重点实验室,南京210096;淮阴工学院计算机工程学院,淮安223003;东南大学生物电子学国家重点实验室,南京,210096 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目 |
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| 摘 要： | 结合模式匹配、生物医学本体及共现技术,设计了一种自动抽取基因与疾病、基因与基因之间关系的文本挖掘方法,并开发了一个可以处理海量文本数据的系统.该系统可抽取与疾病相关的基因实体,挖掘基因与疾病、基因与基因之间的关系,衡量基因与疾病实体的相关性,并为分析基因与疾病、基因与基因之间的关系提供了网络可视化工具.实验结果表明,系统在测试数据集上抽取基因与疾病之间的关系可获得83.0%的综合测评率,抽取基因与基因之间的关系可获得78.5%的综合测评率.该系统已成功应用于乳腺癌及相关基因的研究.
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| 关 键 词： | 生物医学 文本挖掘 关系抽取 实体识别 |
Text mining approach for relationships between genes and diseases |
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| Gong Lejun,Wei Youbing,Xie Jianming,Yuan Zhidong,Sun Xiao. Text mining approach for relationships between genes and diseases[J]. Journal of Southeast University(Natural Science Edition), 2010, 40(3). DOI: 10.3969/j.issn.1001-0505.2010.03.010 |
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| Authors: | Gong Lejun Wei Youbing Xie Jianming Yuan Zhidong Sun Xiao |
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