应用ABEEMσπ/MM方法计算小分子肽的总能量 |
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作者姓名: | 杨忠志 赵洪伟 |
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作者单位: | 辽宁师范大学化学化工学院,辽宁大连,116029 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(20873055;21073080); 辽宁省教育厅创新团队项目(2009T057) |
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摘 要: | 把分子力场(MM)和原子-键电负性均衡方法(ABEEMσπ)协调融合在一起,采用ABEEMσπ/MM方法的分子能量计算方法,选取直链烷烃(n=1~10)、丙酮、丁酮、3-戊酮、N-甲基乙酰胺(NMA)、丙氨酸二肽和若干种氨基酸作为模型分子,计算模型分子能量,从而得到不同类型原子价态能量参数.应用这些原子价态能量参数,计算小分子肽的能量.把所得结果与从头算(MP2/6-311++G(d,p))方法计算的结果相比,得出小分子肽能量的绝对偏差小于9.000 0 kcal/mol,相对偏差小于19.000 0×10-6,且均方根偏差3.450 0 kcal/mol,相对均方根偏差6.919 0×10-6.以上结果表明,ABEEMσπ/MM方法计算的分子能量结果与从头算(MP2/6-311++G(d,p))方法计算的结果具有较好的一致性,此外,用ABEEMσπ/MM方法计算分子能量要远远快于从头算(MP2/6-311++G(d,p))方法.
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关 键 词: | ABEEMσπ/MM 从头算 小分子肽 分子能量 原子价态能量参数 |
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