| 蛋白质在溶液中构象转换的分子动力学模拟 |
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| 引用本文： | 卢滇楠 刘铮. 蛋白质在溶液中构象转换的分子动力学模拟[J]. 石河子大学学报(自然科学版), 2005, 23(6): 661-668 |
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| 作者姓名： | 卢滇楠 刘铮 |
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| 作者单位： | 清华大学化学工程系,北京,100084;清华大学化学工程系,北京,100084 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（20376041）及国家重点基础研究发展规划项目（2003CB716004）. |
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| 摘 要： | 将蛋白质的稳定和失活、折叠和去折叠等现象概括为蛋白质分子在溶液中的构象变化问题。采用非品格模型和Langevin分子动力学方法研究了无限稀释溶液及不同尺度和不同表面亲／疏水性球形限制性空间内β模型蛋白的构象分布及其转换特性。模拟结果显示：尺寸适度的疏水性空间有利于蛋白质结构发生缩塌，而亲水性空间有利于缩塌态蛋白质结构的稳定，且表面亲／疏水性的影响作用随着空间半径的增大而减弱。计算结果与实验报道一致，为研究蛋白质分子在溶液中的折叠和稳定化提供了理论工具。
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| 关 键 词： | 蛋白质折叠 蛋白质稳定化 非晶格模型 Langevin分子动力学 限制性空间 |
| 文章编号： | 1007-7383(2005)06-0661-08 |
| 收稿时间： | 2005-10-26 |
| 修稿时间： | 2005-10-26 |
Molecular Dynamics Simulation of Protein Conformation Transition in Solution |
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| LU Dian-nan, LIU Zheng. Molecular Dynamics Simulation of Protein Conformation Transition in Solution[J]. Journal of Shihezi University(Natural Science), 2005, 23(6): 661-668 |
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| Authors: | LU Dian-nan LIU Zheng |
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| Affiliation: | Department of Chemical Engineering,Tsinghua University, Beijing 100084, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | protein folding protein stabilization off-lattice model Langevin molecular dynamic simulation confined space |
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