| 大戟科植物鲨烯环氧酶核苷酸及其编码氨基酸序列生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王学方,景炳年,周雍,王伟,魏磊.大戟科植物鲨烯环氧酶核苷酸及其编码氨基酸序列生物信息学分析[J].河南科学,2019,37(7):1082-1089. |
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| 作者姓名： | 王学方 景炳年 周雍 王伟 魏磊 |
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| 作者单位： | 河南省生物技术开发中心,河南省植物天然产物开发工程技术研究中心,郑州 450002;河南省生物技术开发中心,河南省植物天然产物开发工程技术研究中心,郑州 450002;河南省生物技术开发中心,河南省植物天然产物开发工程技术研究中心,郑州 450002;河南省生物技术开发中心,河南省植物天然产物开发工程技术研究中心,郑州 450002;河南省生物技术开发中心,河南省植物天然产物开发工程技术研究中心,郑州 450002 |
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| 基金项目： | 河南省科技计划项目;河南省科学院基本科研项目 |
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| 摘 要： | 鲨烯环氧酶(squalene epoxidase,SQE)是在三萜和甾醇类化合物生物合成通路中的关键酶.主要采用生物信息学方法对17种大戟科植物的SQE核苷酸及其编码氨基酸序列的序列结构、理化特性方面以及空间结构进行了初步预测和分析,并构建SQE蛋白家族的系统进化树.结果表明,17种大戟科植物的SQE氨基酸序列结构与理化性质具有一定差异,多为碱性的疏水性蛋白;多数不具有信号肽,没有导肽分裂位点,却具有导肽,具有0～5个数量不等的跨膜结构域;亚细胞定位预测可能定位在内质网膜、质膜、类囊体膜和线粒体内膜上. SQE二级结构中最主要的结构元件是α螺旋和无规则卷曲,保守区都含有一个PLN02985 superfamily保守结构域,属于鲨烯单加氧酶超家族.分析结果可为SQE的酶学特性及三萜类化合物生物合成的分子机制研究提供理论基础.
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| 关 键 词： | 大戟科 生物信息学 鲨烯环氧酶 三萜生物合成 |
Bioinformatics Analysis of Squalene Epoxidase Coding Gene and Amino Acid Sequence in Euphorbiaceae |
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