| 基于 SPA 的蛋白质编码基因的比对 |
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| 引用本文： | 胡刚,沈世镒.基于 SPA 的蛋白质编码基因的比对[J].南开大学学报,2008,41(2):108-112. |
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| 作者姓名： | 胡刚 沈世镒 |
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| 作者单位： | 南开大学数学科学学院,天津300071 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金
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天津市应用基础研究项目 |
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| 摘 要： | 给出了二重比对SPA算法的一个扩展,把SPA算法推广到蛋白质编码基因的比对中.首先利用经典的密码子进化模型,得到了密码子两两的得分矩阵,并用该矩阵对SPA算法进行了修改,使其更加合理有效地应用于蛋白质编码基因的比对.
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| 关 键 词： | SPA算法 密码子模型 蛋白质编码基因 |
| 文章编号： | 0465-7942(2008)02-0108-05 |
| 修稿时间： | 2006年8月24日 |
Protein Coding Gene Alignment Algorithm Based on SPA |
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| Hu Gang,Shen Shiyi.Protein Coding Gene Alignment Algorithm Based on SPA[J].Acta Scientiarum Naturalium University Nankaiensis,2008,41(2):108-112. |
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| Authors: | Hu Gang Shen Shiyi |
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