| A型禽流感病毒的分子模式 |
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| 引用本文： | 寇铮,雷富民,王升跃,周艳红,李天宪.A型禽流感病毒的分子模式[J].科学通报,2008,53(9):1051-1056. |
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| 作者姓名： | 寇铮 雷富民 王升跃 周艳红 李天宪 |
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| 作者单位： | 华中科技大学系统生物学系 湖北省生物信息与分子成像重点实验室，中国科学院动物研究所，中国科学院国家人类基因组研究中心，华中科技大学系统生物学系，湖北省生物信息与分子成像重点实验室，中国科学院武汉病毒研究所，病毒学国家重点实验室，武汉430074 中国科学院武汉病毒研究所，病毒学国家重点实验室，武汉430071，北京100080，上海201203，武汉430074，武汉430071 |
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| 基金项目： | 国家科技基础性工作专项(批准号: 2007FY210700)、国家自然科学基金重大研究计划(批准号: 90608020)、国家重点基础研究发展计划(批准号: 2005CB523007, 2005CB523004)、高等学校博士点专项科研基金(批准号: 20050487037)、中国科学院知识创新工程重要方向性项目(批准号: KSCX2-YW-N-065)及欧盟第六框架项目(批准号: SP5B-CT-2006-044161, SP5B-CT-2006-044405)资助 |
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| 摘 要： | A型禽流感病毒能跨越宿主屏障, 引起人死亡. 高致病性禽流感H5N1亚型病毒就是一个特例. 跨宿主传播的分子机理目前仍不清楚. 将不同亚型的237株流感病毒的内部蛋白序列转化为伪信号, 采用小波包分解的方法提取能量特征. 依据每株病毒的能量特征值, 进行层次聚类. 聚类结果显示, 5种分子模式存在A型禽流感病毒中, 并与跨宿主传播的表型相关联. 分析结果同时显示, 模式为C和E的病毒可以跨越宿主屏障, 而模式为A, B和D的病毒缺乏此种能力. 结果表明, 可以用来构建一个早期预警系统, 用来预测A型禽流感跨越宿主传播的可能性.
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| 关 键 词： | A型禽流感 H5N1 小波包分解 聚类 跨宿主传播 |
| 收稿时间： | 2007-11-22 |
| 修稿时间： | 2008-03-23 |
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