| 25株SIV/HIV的进化分析及意义 |
| |
| 引用本文： | 袁伟,吴宏宇,黄青山. 25株SIV/HIV的进化分析及意义[J]. 复旦学报(自然科学版), 2006, 45(3): 303-308,315 |
| |
| 作者姓名： | 袁伟 吴宏宇 黄青山 |
| |
| 作者单位： | 复旦大学,生命科学学院,遗传学研究所,遗传工程国家重点实验室,上海,200433;上海高科联合生物技术研发有限公司,上海,201206;复旦大学,生命科学学院,遗传学研究所,遗传工程国家重点实验室,上海,200433;上海高科联合生物技术研发有限公司,上海,201206 |
| |
| 基金项目： | 在本次研究中,复旦大学罗祖玉教授给予了非常大的帮助及悉心指导,特此感谢! |
| |
| 摘 要： | 选取了16株SIV和9株HIV毒株,以人T细胞白血病病毒HTLV-1为outgroup,使用CLUSTAL X、PHYLIP及MEGA三种软件对它们的基因组序列及三个主要蛋白(Env,Gag,Pol)序列分别进行了比对分析,用Neighbor-Joining(N-J)方法和Maximum Likelihood(ML)方法分别构建出进化树.结果显示HIV起源于SIV,其中HIV-1的起源与SIVcpz的几种亚型高度相关,HIV-2的起源与SIVsm及SIVmm高度相关.
|
| 关 键 词： | SIV HIV 进化分析 Neighbor-Joining方法 Maximum Likelihood方法 |
| 文章编号： | 0427-7104（2006）03-0303-06 |
| 收稿时间： | 2006-02-14 |
| 修稿时间： | 2006-02-14 |
Phylogenetic Analysis of 25 SIV/HIV Isolates Sequences |
| |
| YUAN Wei,WU Hong-yu,HUANG Qing-shan. Phylogenetic Analysis of 25 SIV/HIV Isolates Sequences[J]. Journal of Fudan University(Natural Science), 2006, 45(3): 303-308,315 |
| |
| Authors: | YUAN Wei WU Hong-yu HUANG Qing-shan |
| |
| Abstract: | 16 SIV and 9 HIV isolates were selected for phylogenetic analysis,with HTLV-1 as an outgroup.CLUSTAL X,PHYLIP and MEGA were used to analysis the genomes and the sequences of Env,Gag,Pol.The phylogenetic trees were constructed by the Neighbor-Joining(N-J) method and Maximum Likelihood(ML) method.The results confirmed that the two clusters of HIV were closely related to the two clusters of SIV.HIV-1 was highly related to several subtypes of SIVcpz and HIV-2 was highly related to SIVsm and SIVmm. |
| |
| Keywords: | SIV HIV phylogenetic analysis Neighbor-Joining method Maximum Likelihood method |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
|
