| 基于位置关联权重矩阵及DNA结构信息预测人类剪接位点 |
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| 引用本文： | 张鹏飞,李前忠,左永春,李涛.基于位置关联权重矩阵及DNA结构信息预测人类剪接位点[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2010,41(4). |
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| 作者姓名： | 张鹏飞 李前忠 左永春 李涛 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学物理科学与技术学院,呼和浩特,010021 |
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| 基金项目： | 内蒙古优秀学科带头人计划资助项目 |
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| 摘 要： | 人类剪接位点的识别是当前研究的一个重要课题.根据人类剪接位点附近区域的保守性,以位置关联权重矩阵及DNA结构信息作为特征输入参数,应用支持向量机(SVM)对人类基因组中的供体端和受体端剪接位点做了预测.对于供体端,5-fold交叉检验总体预测精度为92.55%,3-way data split检验总体预测精度为92.25%;受体端5-fold交叉检验总体预测精度为90.70%,3-way data split检验总体预测精度为89.87%.
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| 关 键 词： | 剪接位点 位置关联权重矩阵 DNA结构信息 |
Predicting the Splice Sites of Human Genome Based on Position-correlation Weight Matrix and DNA Structural Parameters |
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| ZHANG Peng-fei,LI Qian-zhong,ZUO Yong-chun,LI Tao.Predicting the Splice Sites of Human Genome Based on Position-correlation Weight Matrix and DNA Structural Parameters[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol,2010,41(4). |
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| Authors: | ZHANG Peng-fei LI Qian-zhong ZUO Yong-chun LI Tao |
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| Institution: | ZHANG Peng-fei,LI Qian-zhong,ZUO Yong-chun,LI Tao(School of Physical Science and Technology,Inner Mongolia University,Hohhot 010021,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | splice site position-correlation weight matrix(PCWM) DNA structural parameters |
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