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| 果蝇核糖体蛋白基因中潜在转录协同作用模体的统计分析 | |
| 引用本文： | 李慧敏,胡〓俊,张〓静. 果蝇核糖体蛋白基因中潜在转录协同作用模体的统计分析[J]. 云南大学学报(自然科学版), 2010, 32(3): 338-345 |
| 作者姓名： | 李慧敏 胡〓俊 张〓静 |
| 作者单位： | 1. 云南大学生命科学学院生物资源保护和利用重点实验室, 云南昆明 650091; 2. 云南大学数学与统计学院统计系, 云南昆明 650091 |
| 摘 要： | 首先基于频率分析方法抽提出果蝇核糖体蛋白(RP)基因外显子上游直至第1个内含子结束的序列(称为启动子)中潜在的调控模体,这些模体中有85%与实验上的转录因子匹配.然后将抽提出的模体两两配对,运用超几何分布找出出现条数比例在RP基因中显著高于在背景启动子中的模体对,并进一步用K-S检验提取出它们在RP基因中的距离分布与背景距离分布有显著差异的模体对,这些模体对被认为具有转录协同作用.它们中的一部分与实验结果匹配.分析提取出的模体对在序列中的位置分布,发现它们主要的协同作用区域是上游区,而上游和内含子之间的协同作用也是一种重要的组合调控形式,同时发现模体对的模体间距离大部分位于300bp以内,并且在第一外显子附近较为集中.这些结果将有助于对RP基因转录调控机制的认识. |
| 关 键 词： | 果蝇 RP基因 基因上游 外显子 内含子 协同作用 |
Statistical analysis of potential synergistic motifs of thetranscriptional regulation in ribosomal protein genes of fruit fly |
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| LI Hui-min,HU Jun,ZHANG Jing. Statistical analysis of potential synergistic motifs of thetranscriptional regulation in ribosomal protein genes of fruit fly[J]. Journal of Yunnan University(Natural Sciences), 2010, 32(3): 338-345 | |
| Authors: | LI Hui-min HU Jun ZHANG Jing |
| Affiliation: | 1. Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-resources, Yunnan University, Kunming 650091, China; 2. School of Mathematics and Statistics, Yunnan University, Kunming 650091, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
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