| 大肠杆菌O96 O-抗原基因簇的破译和特异基因的鉴定 |
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| 引用本文： | 夏秋雨,王威,韩巍青,冯露,王磊,耿运琪. 大肠杆菌O96 O-抗原基因簇的破译和特异基因的鉴定[J]. 南开大学学报(自然科学版), 2005, 38(2): 54-59 |
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| 作者姓名： | 夏秋雨 王威 韩巍青 冯露 王磊 耿运琪 |
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| 作者单位： | 南开大学,生命科学学院,天津,300071;南开大学,生命科学学院,天津,300071;南开大学,生命科学学院,天津,300071;南开大学,生命科学学院,天津,300071;南开大学,生命科学学院,天津,300071;南开大学,生命科学学院,天津,300071 |
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| 基金项目： | 国家863基因芯片专项资助项目(2002AA2Z2051)国家自然科学基金资助项目(30270029) |
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| 摘 要： | 大肠杆菌O96血清型的大肠杆菌近年来频繁地出现于分离到的致病菌株中，在发展中国家和发达国家均有发现，有造成爆发性流行的可能．本文利用鸟枪法对大肠杆菌O960～抗原基因族进行测序，序列全长9415bp，用生物信息学的方法进行序列分析，共发现7个基因，分别是：吡喃型UDP-半乳糖变位酶基因(glf)，O-抗原转运酶基因(wzx)，O-抗原聚合酶基因(wzy)和糖基转移酶基因(4个)．本文分析了大肠杆菌O96和K12(016)的O-抗原基因族中吡喃型UDP-半乳糖变位酶基因和O-抗原转运酶基因的进化关系，确定了吡喃型UDP-半乳糖变位酶的基序；用PCR的方法筛选出了2个针对大肠杆菌O96的特异基因，可以用于基因芯片或PCR方法快速检测大肠杆菌O96。
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| 关 键 词： | 大肠杆菌O96 O-抗原 特异基因 |
| 文章编号： | 0465-7942(2005)02-0054-06 |
| 修稿时间： | 2003-09-22 |
Sequence of Escherichia Coli O96 O-antigen Gene Cluster and Identification of Specific Genes |
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| Xia Qiuyu,Wang Wei,Han Weiqing,Feng Lu,Wang Lei,Geng Yunqi. Sequence of Escherichia Coli O96 O-antigen Gene Cluster and Identification of Specific Genes[J]. Acta Scientiarum Naturalium University Nankaiensis, 2005, 38(2): 54-59 |
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| Authors: | Xia Qiuyu Wang Wei Han Weiqing Feng Lu Wang Lei Geng Yunqi |
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| Abstract: | The escherichia coli O96 O-antigen gene cluster was sequenced. It was found to contain the genes for UDP-galactopyranose mutase (glf), O-unit flippase (wzx ), O-antigenpolymerase (wzy) and putative transferases. We proposed the genes glf and wzx were evolutionarily related to those of E. coli K12 (O16). We also proposed the motif for UDP-galactopyranose mutase. By polymerase chain reaction against representative stains for the all 166 E. coli and 43 Shigella O serotypes, we identified 2 genes that are highly specific to E. coli O96. This work provides the basis for a quick and sensitive test of the rapid detection of E. coli O96 by DNA array and PCR method. |
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| Keywords: | Escherichia Coli O96 O-antigen specific gene |
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