山羊GDF9基因编码区nsSNPs的生物信息学分析 |
| |
作者单位: | 河北科技师范学院动物科技学院河北省特色动物种子资源挖掘与创新重点实验室,河北秦皇岛,066600 |
| |
基金项目: | 河北省羊产业技术体系创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目 |
| |
摘 要: | 为筛选山羊GDF9基因的功能性nsSNPs,利用生物信息学技术对该基因编码区nsSNPs进行了有害位点的预测,进一步对有害nsSNPs在GDF9蛋白的位置、进化保守性及其对编码蛋白的稳定性、高级结构的影响等进行了预测分析,同时分析了该蛋白的泛素化修饰位点和磷酸化修饰位点。结果表明,山羊GDF9基因编码区14个nsSNPs中存在6个有害突变位点(R453H,V371M,P348S,F347S,S325Y,L266S),均不在蛋白跨膜区;R453H,V371M,P348S,L266S属于高保守性位点;R453H,V371M,P348S,F347S,L266S可降低蛋白的稳定性;V371M,L266S可能参与了蛋白二级结构的形成;R453H,V371M,L266S对蛋白三级结构有影响。推测有害突变位点R453H,V371M,P348S,F347S,S325Y,L266S可能是山羊GDF9基因的功能性nsSNPs。
|
关 键 词: | 山羊 GDF9基因 nsSNPs 生物信息学分析 |
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录! |
|