水稻5S rDNA和着丝粒顺序RCS2拷贝数的Fiber-FISH测定 |
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引用本文: | 李宗芸,黄思罗,金危危,宁顺斌,宋运淳,李立家.水稻5S rDNA和着丝粒顺序RCS2拷贝数的Fiber-FISH测定[J].科学通报,2001,46(19):1641-1644. |
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作者姓名: | 李宗芸 黄思罗 金危危 宁顺斌 宋运淳 李立家 |
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作者单位: | 武汉大学植物发育生物学教育部重点实验室 |
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基金项目: | 感谢美国Wisconsin大学Jiang
Jiming教授帮助作者建立了Fiber-FISH实验体系,并提供着丝粒探针和个人相关研究资料,感谢美国Iowa大学H.H.Heng教授,荷兰Wangeningen农业大学J.Hans
de Jong教授提供个人相关 |
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摘 要: | 用伸展DNA纤维的荧光原位杂交(Fiber-FISH)技术测定了5S rDNA和着丝粒DNA顺序RCS2在水稻广陆矮四号(Oryza sativa ssp indica cv Guangluai No4)基因组中的拷贝数,为了确定拷贝数,需要知道显微镜下一定长度DNA纤维所含碱基对数。为此,测量了两个已知碱基对数DNA序列的伸展纤维在显微镜下的长度。其中供试BAC38D17的插入序列为136kb,基伸展纤维在显微镜下的长度为56.4μm,平均为2.41kb/μm;BAC44B4全长为144.5kb,其伸展纤维的长度为55.7μm,平均为2.60kb/μm.这与Watson-Crick模型中B-DNA的2.97kb/μm十分接近。根据两个样本每微米平均碱基数,即2.51kb/μm的标准,计算出5SrDNA的拷贝数约为686,着丝粒DNA顺序约为286-1121拷贝。
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关 键 词: | 着丝粒DNA顺序 5S rDNA 拷贝数 DNA纤维荧光原位杂交 DNA Fiber-FISH 水稻 碱基对数 |
收稿时间: | 2001-04-19 |
修稿时间: | 2001-07-19 |
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