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扬子鳄的线粒体全基因组与鳄类系统发生
作者姓名:吴孝兵  王义权  周开亚  朱伟铨  聂继山  王朝林
作者单位:1. 南京师范大学生命科学学院,南京,210097;安徽师范大学生命科学学院,芜湖,241000
2. 南京师范大学生命科学学院,南京,210097;厦门大学生命科学学院,厦门,361005
3. 南京师范大学生命科学学院,南京,210097
4. 安徽省扬子鳄繁殖研究中心,宣州,242034
基金项目:本工作为教育部骨干教师资助计划(批准号: GG-180-21002403-1740)和教育部留学回国人员启动基金资助项目.
摘    要:通过酶切、克隆、测序, 结合Long-PCR和Primer Walking法对扬子鳄线粒体DNA基因组进行全序列测定. 结果表明, 扬子鳄线粒体基因组DNA序列全长为16746 bp, 其基因组碱基组成为29.43%A, 24.59%T, 14.86%G, 31.12%C. 与其他大多数脊椎动物相同, 其基因组由13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因及1个非编码的控制区(D-loop)组成. 基因的排列与已测序的鳄类相似. 在全序列分析的基础上, 对12S rRNA基因序列、16S rRNA基因序列、蛋白质编码基因序列及其合并数据用MP法和ML法构建系统发生树, 结果表明扬子鳄与密河鳄的亲缘关系较近, 支持传统观点. 根据ML树的支长数值估计钝吻鳄属发生的时间为74.9 MaBP, 扬子鳄与密河鳄分歧的时间为50.9 MaBP.

关 键 词:扬子鳄  线粒体基因组  全序列  系统发生  分歧时间
收稿时间:2003-05-05
修稿时间:2003-05-05
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