| 赛黑桦matK基因生物信息学分析 |
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| 作者姓名： | 高宇婷 林琳 姚殿国 周立平 许建闻 穆怀志 |
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| 作者单位： | 北华大学林学院,吉林 吉林,132013;中国铁路沈阳局集团有限公司长春林业总场,吉林 长春,130501;集安市林业局,吉林 集安,134200 |
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| 基金项目： | 吉林省教育厅科学技术研究项目;北华大学青年培育基金项目 |
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| 摘 要： | matK基因广泛应用于植物亲缘关系和物种鉴定研究.利用生物信息学对赛黑桦matK基因进行开放阅读框、氨基酸组成、蛋白质跨膜结构区、亚细胞定位和结合区分析,预测信号肽、氨基酸亲/疏水性、氨基酸二级结构,利用同源建模构建赛黑桦成熟酶K的三维结构及12种桦木属植物的系统进化树.结果表明:赛黑桦matK基因序列长度为2 524 bp,有13个开放阅读框; matK基因编码的成熟酶K含20种氨基酸,由17. 86%的α螺旋、9.52%的β折叠和72. 62%的无规则卷曲组成,为亲水性蛋白,具有10个蛋白结合区和1个多核苷酸结合区;赛黑桦与白桦、真桦、沼桦、甸生桦、绒毛桦和垂枝桦的亲缘关系较近.研究结果可为赛黑桦苗期的分子鉴定提供参考.
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| 关 键 词： | 赛黑桦 matK基因 生物信息学 系统进化树 |
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