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| 支持向量机方法预测七鳃鳗miRNA前体 | |
| 作者姓名： | 张洁 李庆伟 邹丽 |
| 作者单位： | 辽宁师范大学生命科学学院;辽宁师范大学七鳃鳗研究中心;辽宁师范大学计算机与信息技术学院;南京大学计算机软件新技术国家重点实验室 |
| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973)(2013CB835304);国家自然科学基金(61175055) |
| 摘 要： | 将七鳃鳗miRNA前体(pre-miRNA)序列的结构特征作为支持向量机工具Lib-SVM的输入向量,经Grid程序优化参数后,开发序列预测程序Lj-miRSVM,通过10倍交叉法验证,平均敏感性和特异性分别为95%和95.9%,准确率为95.8%,接收者操作特征曲线(ROC)下的面积比约为98.9%。用Lj-miRSVM预测其他20个物种的pre-miRNA,平均正确率为78.5%。 |
| 关 键 词： | 七鳃鳗 支持向量机 miRNA前体预测 ROC曲线 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ | |