AP 数据源融合算法构建基因调控网络 |
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作者姓名: | 郑明 刘桂霞 卓慕瑰 |
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作者单位: | 梧州学院广西高校行业软件技术重点实验室,广西梧州543002;吉林大学计算机科学与技术学院,长春 130012;吉林大学计算机科学与技术学院,长春,130012;梧州学院广西高校行业软件技术重点实验室,广西梧州,543002 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;广西自然科学基金;梧州学院科研项目 |
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摘 要: | 针对单一数据集构建基因调控网络算法数据量不足及构建网络结果不精确的问题, 提出一种基于能力与信任(AP)的数据源融合算法. 该算法将基因表达数据、 蛋白质相互作用数据和基序数据集, 分别通过控制与被控制双向数据流传输来分析和构建基因调控网络, 并与ReMoDiscovery,CLR和C3Net三种已开发模型在酵母全基因组网络构建结果的AUC值进行对比. 对比结果表明, 该算法在构建基因调控网络算法方面执行效率更高、 收敛性更强.
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关 键 词: | A P算法 数据源融合 基因调控网络 全基因组关联 |
收稿时间: | 2018-08-05 |
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