微泡菌ALW1几丁质酶Chi18A的克隆及信息学分析 |
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引用本文: | 李鹤宾,梁梅芳,陈仲巍,姜泽东,倪辉,朱艳冰.微泡菌ALW1几丁质酶Chi18A的克隆及信息学分析[J].集美大学学报(自然科学版),2019(3). |
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作者姓名: | 李鹤宾 梁梅芳 陈仲巍 姜泽东 倪辉 朱艳冰 |
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作者单位: | 厦门医学院药学系;集美大学食品与生物工程学院 |
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摘 要: | 以微泡菌(Microbulbifer sp.)ALW1的基因组为模板,利用几丁质酶基因的特异性引物进行PCR扩增,然后将产物插入到pMD18-T载体后进行DNA序列测定,并对目的基因编码的蛋白质序列进行信息学分析。结果显示,克隆的目的基因大小为1644 bp,预测编码含有547个氨基酸残基的蛋白质。该蛋白质序列与其他菌株来源的几丁质酶序列具有70%左右的相似性,表明预测目的基因编码几丁质酶。该蛋白质具有2个几丁质结合结构域和1个GH18家族酶的催化结构域,属于糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH)家族18,命名为几丁质酶Chi18A。模拟的三维结构显示,Chi18A含有(βα)_8桶状结构。
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