| 希金斯炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 韩长志. 希金斯炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析[J]. 华中师范大学学报(自然科学版), 2015, 49(2): 246-251 |
| |
| 作者姓名： | 韩长志 |
| |
| 作者单位： | 西南林业大学林学院,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明650224 |
| |
| 基金项目： | 云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目，云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队，云南省教育厅科学研究基金项目，国家自然科学基金青年科学基金项目 |
| |
| 摘 要： | 希金斯炭疽菌可以侵染诸多十字花科植物引起炭疽病,给各国农业生产造成了巨大经济损失.GPCR作为生物体内G蛋白信号转导途径中的重要感知蛋白,在信号传递过程中发挥着重要作用.本研究基于酿酒酵母中已经报道的3个典型GPCR序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,以及通过TMHMM、HMMTOP跨膜结构域分析,明确该菌存在4个典型的GPCR;同时,通过对上述氨基酸序列进行细胞信号肽、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析,明确上述GPCR均具有较高比例的α螺旋结构以及均不含有明显的信号肽序列;在定位方面,4个GPCR均定位在质膜上.此外,通过对希金斯炭疽菌中的4个GPCR与其他物种中的23个同源序列进行遗传关系比较分析,发现该菌中的GPCR与C.graminicola、C.fioriniae等炭疽菌属中的病菌具有较高的同源序列以及较近的亲缘关系.该研究为深入开展希金斯炭疽菌GPCR功能研究打下坚实的理论基础,同时,也为进一步开展其他炭疽菌的研究提供重要的理论指导.
|
| 关 键 词： | 希金斯炭疽菌 G蛋白偶联受体 信号肽 二级结构 炭疽菌属 |
Bioinformatics analysis on G protein-coupled receptors in Colletotrichum higginsanum |
| |
| HAN Changzhi. Bioinformatics analysis on G protein-coupled receptors in Colletotrichum higginsanum[J]. Journal of Central China Normal University(Natural Sciences), 2015, 49(2): 246-251 |
| |
| Authors: | HAN Changzhi |
| |
| Affiliation: | HAN Changzhi;College of Forestry,Southwest Forestry University,The Key Laboratory of Forest Disaster Warning and Control of Yunnan Province; |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Colletotrichum higginsanum GPCR signal peptide secondary structure Colletotrichum spp |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《华中师范大学学报(自然科学版)》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《华中师范大学学报(自然科学版)》下载全文 |
