基于LightGBM的蛋白质类泛素化修饰位点预测 |
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作者姓名: | 陈焕超 魏志森 於东军 杨敬民 杨静宇 |
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作者单位: | 闽南师范大学计算机学院,福建 漳州363000;闽南师范大学数据科学与智能应用福建省高校重点实验室,福建 漳州363000;南京理工大学 计算机科学与工程学院,江苏 南京210094 |
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基金项目: | 福建省自然科学基金项目;福建省教育厅中青年项目 |
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摘 要: | 蛋白质类泛素化修饰位点的准确识别对基础研究和药物开发都具有重要意义.该文提出了一种基于蛋白质序列特征的类泛素化修饰位点预测模型.该模型结合氨基酸的物理化学属性统计特征和氨基酸序列二元语法模式特征,训练一种轻量型梯度提升机(Light gradient boosting machine,LightGBM)分类器预测某个蛋...
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关 键 词: | 蛋白质翻译后修饰 蛋白质类泛素化修饰位点 基于序列的预测 轻量型梯度提升机 二元语法模式 |
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