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医蛭形亚目常见物种系统发育基因组学研究
引用本文:赵芳,蒋凯,苏田娟,何波,吴清,林恭华,黄族豪. 医蛭形亚目常见物种系统发育基因组学研究[J]. 井冈山大学学报(自然科学版), 2021, 42(4): 41-47
作者姓名:赵芳  蒋凯  苏田娟  何波  吴清  林恭华  黄族豪
作者单位:井冈山大学生命科学学院,江西,吉安 343009;江西康之康中药科技有限公司,江西,吉安 343009
基金项目:国家自然科学基金项目(31860105,31960219);江西省教育厅科技计划项目(GJJ201007)
摘    要:本研究基于GenBank中10个医蛭形亚目物种及2个近缘外类群的基因组或转录组数据,提取COI、18 S和蛋白编码核基因的直系同源序列(Orthologs),开展系统发育分析。比对后的COI、18 S和Orthologs序列长度分别为1533、1832、220095 bp。最大似然法和贝叶斯推断法分析显示,基于Orthologs序列构建的系统发育树在几乎所有节点上的支持率都达到100%,明显优于COI和18 S序列得到的结果。研究表明,医蛭科的欧洲医蛭、东方医蛭和侧纹医蛭组成一个单系群,医蛭科的日本医蛭与黄蛭科的宽体金线蛭和尖细金线蛭组成另一单系群,而黄蛭科的马蛭与上述6个物种形成姐妹群。医蛭科的两种牛蛭(菲牛蛭和棒纹牛蛭)组成一个单系群,此单系群与医蛭科的其他物种的遗传关系比马蛭更疏远;山蛭科的洞穴山蛭在10个医蛭形亚目种类中处于最基部位置。本研究阐明了医蛭形亚目常见物种的系统发育关系,为这些物种的资源开发利用和保护提供科学依据。

关 键 词:医蛭形亚目  基因组  转录组  系统发育
收稿时间:2021-03-12
修稿时间:2021-05-12

Phylogenomics of common species in Hirudiniformes
ZHAO Fang,JIANG Kai,SU Tian-juan,HE Bo,WU Qing,LIN Gong-hu,HUANG Zu-hao. Phylogenomics of common species in Hirudiniformes[J]. Journal of Jinggangshan University(Natural Sciences Edition), 2021, 42(4): 41-47
Authors:ZHAO Fang  JIANG Kai  SU Tian-juan  HE Bo  WU Qing  LIN Gong-hu  HUANG Zu-hao
Affiliation:School of Life Sciences, Jinggangshan University, Ji''an, Jiangxi 343009, China;Jiangxi Kangzhikang Traditional Chinese Medicine Science and Technology Ltd, Ji''an, Jiangxi 343009, China
Abstract:
Keywords:
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