支持向量机程序SVMProt预测SArs病毒蛋白质的功能 |
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引用本文: | 蔡从中 韩连漪 王万录 陈宇综. 支持向量机程序SVMProt预测SArs病毒蛋白质的功能[J]. 重庆大学学报(自然科学版), 2003, 26(9): 148-150 |
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作者姓名: | 蔡从中 韩连漪 王万录 陈宇综 |
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作者单位: | [1]重庆大学应用物理系,重庆400044 [2]新加坡国立大学计算科学系,新加坡117543,重庆400044 |
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基金项目: | 重庆大学与新加坡国立大学国际联合科研资助项目(ARF-151-000-014-112),重庆大学基础及应用基础研究基金资助项目(71341103),重庆大学研究生抗"非典"科技攻关实践基金资助项目(2003-023) |
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摘 要: | 对SARS冠状病毒蛋白质功能的有效识剐将有利于促进SARS传染病治疗药物的开发。应用基于支持向量机原理的SVMProt程序识别SARS冠状病毒蛋白质的功能,通过对SARS冠状病毒中2个已知功能的蛋白质功能的成功预测,说明SVMProt能够有效地应用于SARS冠状病毒蛋白质及其他种类蛋白质的功能预测。对SARS冠状病毒中至今仍未知其功能的蛋白质ORFl3的功能进行了预测,结果显示ORFl3是一种可能与DNA结合的核蛋白并兼有病毒体内结构蛋白的功能。
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关 键 词: | 非典 SARS冠状病毒蛋白质 蛋白质功能 蛋白质功能预测 支持向量机 |
文章编号: | 1000-582X(2003)09-0148-03 |
修稿时间: | 2003-05-27 |
Prediction of the Function of SARS Proteins by Using a Support Vector Machine Program SVMProt |
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Abstract: | |
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Keywords: | SARS SARS coronavirus protein protein function protein function prediction support vector machine |
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