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支持向量机程序SVMProt预测SArs病毒蛋白质的功能
引用本文:蔡从中 韩连漪 王万录 陈宇综. 支持向量机程序SVMProt预测SArs病毒蛋白质的功能[J]. 重庆大学学报(自然科学版), 2003, 26(9): 148-150
作者姓名:蔡从中 韩连漪 王万录 陈宇综
作者单位:[1]重庆大学应用物理系,重庆400044 [2]新加坡国立大学计算科学系,新加坡117543,重庆400044
基金项目:重庆大学与新加坡国立大学国际联合科研资助项目(ARF-151-000-014-112),重庆大学基础及应用基础研究基金资助项目(71341103),重庆大学研究生抗"非典"科技攻关实践基金资助项目(2003-023)
摘    要:对SARS冠状病毒蛋白质功能的有效识剐将有利于促进SARS传染病治疗药物的开发。应用基于支持向量机原理的SVMProt程序识别SARS冠状病毒蛋白质的功能,通过对SARS冠状病毒中2个已知功能的蛋白质功能的成功预测,说明SVMProt能够有效地应用于SARS冠状病毒蛋白质及其他种类蛋白质的功能预测。对SARS冠状病毒中至今仍未知其功能的蛋白质ORFl3的功能进行了预测,结果显示ORFl3是一种可能与DNA结合的核蛋白并兼有病毒体内结构蛋白的功能。

关 键 词:非典 SARS冠状病毒蛋白质 蛋白质功能 蛋白质功能预测 支持向量机
文章编号:1000-582X(2003)09-0148-03
修稿时间:2003-05-27

Prediction of the Function of SARS Proteins by Using a Support Vector Machine Program SVMProt
Abstract:
Keywords:SARS  SARS coronavirus protein  protein function  protein function prediction  support vector machine
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