基于双层生物分子网络的致病基因预测 |
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引用本文: | 王路宽,吴舜尧.基于双层生物分子网络的致病基因预测[J].青岛大学学报(自然科学版),2022(1):48-52. |
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作者姓名: | 王路宽 吴舜尧 |
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作者单位: | 青岛大学计算机科学技术学院 |
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基金项目: | 山东省自然科学基金(批准号:ZR2019PF012)资助;;山东省高等学校科技计划(批准号:J18KA356)资助; |
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摘 要: | 基于“致病基因邻居倾向于引起相似疾病”和“必需基因和致病基因关联较少”的假设,融合蛋白质相互作用和代谢通路,构建双层生物分子网络,提出一种基于双层生物分子网络双流量网络传播的致病基因排序方法。为致病基因和必需基因分配正流量和负流量,挖掘与已知致病基因相似的潜在致病基因。实验结果表明,本方法与基于经典假设的单层网络方法相比,在富集分数1和富集分数2分别提高11.66和13.66。
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关 键 词: | 致病基因预测 网络传播 蛋白质相互作用 代谢通路 |
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