| 使用多样性增量预测磷酸化位点 |
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| 引用本文： | 张颖,罗辽复,吕军. 使用多样性增量预测磷酸化位点[J]. 内蒙古大学学报(自然科学版), 2008, 39(1): 34-39 |
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| 作者姓名： | 张颖 罗辽复 吕军 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学理工学院理论生物物理研究室,呼和浩特,010021;内蒙古工业大学物理系,呼和浩特,010051;内蒙古大学理工学院理论生物物理研究室,呼和浩特,010021 |
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| 摘 要： | 磷酸化是蛋白质最重要的翻译后修饰之一.应用基于多样性增量的二次判别分析 (Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法对CK2,PKA和PKC三种类型磷酸化位点进行预测,k-fold交叉检验的正确率分别为86%,90%和85%,独立测试集检验的正确率分别为86%,88%和84%.所得结果高于包括支持向量机在内的现有预测方法.
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| 关 键 词： | 蛋白质磷酸化位点 多样性增量 二次判别分析 |
| 文章编号： | 1000-1638（2008）01-0034-06 |
| 收稿时间： | 2007-04-23 |
| 修稿时间： | 2007-04-23 |
Predicting Phosphorylation Sites by Use of a Diversity Measure |
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| ZHANG Ying,LUO Liao-fu,LU Jun. Predicting Phosphorylation Sites by Use of a Diversity Measure[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol, 2008, 39(1): 34-39 |
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| Authors: | ZHANG Ying LUO Liao-fu LU Jun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | protein phosphorylation site increment of diversity quadratic discriminant analysis |
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