| NaCl胁迫下红砂种子萌动期差异表达基因的转录组分析 |
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| 引用本文： | 刘晓威,杨秀艳,武海雯,刘肖艳,朱建峰,张华新. NaCl胁迫下红砂种子萌动期差异表达基因的转录组分析[J]. 南京林业大学学报(自然科学版), 2019, 62(3): 28-36. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201811020 |
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| 作者姓名： | 刘晓威 杨秀艳 武海雯 刘肖艳 朱建峰 张华新 |
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| 作者单位： | 1.国家林业和草原局盐碱地研究中心,北京 100091; 2.河南农业大学生命科学学院,河南 郑州 450000 |
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| 基金项目： | 国家林业局948项目(2015-4-12);国家重点研发计划(2016YFC0501303) |
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| 摘 要： | 【目的】筛选NaCl胁迫下红砂萌发期的差异表达基因,为耐盐碱树种选育提供基因资源。【方法】以前期拟合的萌发阈值浓度(273 mmol/L,记为M)、最适萌发浓度(43 mmol/L,记为L)、蒸馏水(记为C)处理红砂种子,每个处理3次重复,待胚根突破种皮,不超过2 mm时取出,进行转录组测序。【结果】分别在L与C对比组(记为LvsC)、M与C对比组(记为MvsC)、M与L对比组(记为MvsL)中筛选出210、2 273、2 888个差异表达基因,其中LvsC中116个上调表达,94个下调表达; MvsC中1 781个上调表达,492个下调表达; MvsL中2 165个上调表达,723个下调表达; 上调表达基因在KEGG富集中主要集中在核糖体、碳代谢、细胞色素P450代谢、谷胱甘肽代谢等途径,下调表达基因主要富集在蔗糖淀粉代谢、内质网蛋白质加工等过程。【结论】盐胁迫条件下,差异基因诱导相关反应协同发挥作用,最终使胚轴细胞伸长,突破种皮完成萌发。
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| 关 键 词： | 红砂 NACL胁迫 种子萌发 差异表达基因 转录组分析 |
Transcriptome analysis of differentially expressed genes in Reaumuria soongorica seeds germination under NaCl stress |
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| LIU Xiaowei,YANG Xiuyan,WU Haiwen,LIU Xiaoyan,ZHU Jianfeng,ZHANG Huaxin. Transcriptome analysis of differentially expressed genes in Reaumuria soongorica seeds germination under NaCl stress[J]. Journal of Nanjing Forestry University(Natural Sciences ), 2019, 62(3): 28-36. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201811020 |
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| Authors: | LIU Xiaowei YANG Xiuyan WU Haiwen LIU Xiaoyan ZHU Jianfeng ZHANG Huaxin |
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| Affiliation: | (Research Center of Saline and Alkali Land of State Forestry and Grassland Administration, Beijing 100091, China;College of Life Sciences of Henan Agricultural University, Zhengzhou 450000,China) |
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| Abstract: | LIU Xiaowei;YANG Xiuyan;WU Haiwen;LIU Xiaoyan;ZHU Jianfeng;ZHANG Huaxin(Research Center of Saline and Alkali Land of State Forestry and Grassland Administration, Beijing 100091, China;College of Life Sciences of Henan Agricultural University, Zhengzhou 450000,China) |
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| Keywords: | |
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