红锥根系响应石墨烯的转录组学研究 |
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引用本文: | 白秀丽,庞敏,刘泽慧,乔俊,李伟佳,淮泽勋,王海雁,赵建国,陈志文.红锥根系响应石墨烯的转录组学研究[J].首都师范大学学报(自然科学版),2023(2):43-52. |
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作者姓名: | 白秀丽 庞敏 刘泽慧 乔俊 李伟佳 淮泽勋 王海雁 赵建国 陈志文 |
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作者单位: | 山西大同大学炭材料研究所,化学与工程学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金面上项目(52071192); |
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摘 要: | 为了研究石墨烯对植物根系响应的分子机制和转录组学,本文以0、25、33和50 mg/L共4组质量浓度的石墨烯溶液培育红锥(Castanopsis hystrix Miq.)幼苗,其中石墨烯溶液质量浓度为0指以蒸馏水培育,并对红锥幼苗的根系发育情况、基因表达量的变化、差异表达基因的富集通路和范围进行了分析。与0相比,25 mg/L石墨烯溶液对红锥幼苗根系发育的促进效果最佳(t=2.86~7.80,P<0.05);转录组数据表明,25 mg/L石墨烯溶液处理红锥根系后,导致12 845个基因的表达量发生差异,其中石墨烯诱导10 899个基因表达量上调,抑制1 946个基因的表达量。通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集性分析表明:表达量上调的基因主要富集于126个KEGG通路,表达量下调的基因富集于99个KEGG通路;另外,110个转录因子基因差异表达,可归类于33个不同家族,其中ERF、WRKY、MYB、NAC、bHLH、TCP和Trihelix共7个家族基因与红锥根系发育有关;9种植物激素信号转导通路相关的差异表达基因结果表明生长素、细胞分裂素、赤霉素、乙烯、水杨酸、油...
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关 键 词: | 石墨烯 红锥 根系 差异表达基因 转录因子与激素 |
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