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藏鸡THRSP基因的克隆及生物信息学分析
引用本文:聂晓庆,徐亚欧,吕明,左璐璐,李想,林亚秋.藏鸡THRSP基因的克隆及生物信息学分析[J].西南民族学院学报(自然科学版),2015,41(4).
作者姓名:聂晓庆  徐亚欧  吕明  左璐璐  李想  林亚秋
作者单位:西南民族大学生命科学与技术学院,四川 成都,610041
基金项目:四川应用基础项目,四川省畜禽育种攻关项目,西南民族大学项目
摘    要:对藏鸡THRSP基因进行克隆、序列测定及生物信息学分析.结果表明:获得的藏鸡THRSP基因核苷酸序列为428 bp(GenBank登陆号:KT153607),在50-258 bp处存在1个CpG岛,ORF长度为390 bp,编码129个氨基酸,其中Leu所占比例为10.9%.THRSP蛋白分子量为14.18 ku,等电点(pI)为4.61,属于不稳定酸性核蛋白,存在8个磷酸化位点和5个O糖基化位点.预测其二级结构中α螺旋占51.2%,β折叠占3.1%,无规则卷曲占45.7%.同源性分析结果表明:藏鸡与原鸡THRSP基因核苷酸及预测的氨基酸序列同源性为100%,两者亲缘关系最近.

关 键 词:藏鸡  THRSP  基因克隆  生物信息学分析

Cloning and bioinformatics analysis of THRSP in Tibetan chicken
NIE Xiao-qing,XU Ya-ou,LU Ming,ZUO Lu-lu,LI Xiang,LIN Ya-qiu.Cloning and bioinformatics analysis of THRSP in Tibetan chicken[J].Journal of Southwest Nationalities College(Natural Science Edition),2015,41(4).
Authors:NIE Xiao-qing  XU Ya-ou  LU Ming  ZUO Lu-lu  LI Xiang  LIN Ya-qiu
Abstract:
Keywords:
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