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甜瓜持绿蛋白的生物信息学分析
作者姓名:巴德仁贵  殷振琦  李爽  马勇  哈斯阿古拉
作者单位:内蒙古大学生命科学学院;内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室;
基金项目:国家自然科学基金资助项目(No.31360486)
摘    要:采用生物信息学方法,对甜瓜持绿蛋白(stay-green protein,SGR)理化性质、信号肽、前导肽、功能型位点、疏水性和亲水性、跨膜结构域、蛋白质二级结构和三级结构进行预测和分析,并构建系统进化树.结果表明:甜瓜含有4个持绿蛋白家族成员,进化分析发现有2个同源基因对,同源的基因对之间功能上完全冗余,4个蛋白都不具有信号肽和跨膜结构域,属于非分泌型蛋白,推测SGR可能在细胞质基质中发挥功能.采用同源建模法预测其三级结构,并通过拉氏构象图分析准确性和合理性,证明了同源建模的结果相对可靠性.

关 键 词:甜瓜  持绿蛋白  基因家族  生物信息学分析
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