| 基于氨基酸亲疏水分布的最小离散增量方法识别蛋白质超家族 |
| |
| 引用本文： | 刘芬,李前忠.基于氨基酸亲疏水分布的最小离散增量方法识别蛋白质超家族[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2006,37(4):416-423. |
| |
| 作者姓名： | 刘芬 李前忠 |
| |
| 作者单位： | 内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021 |
| |
| 摘 要： | 摆脱目前常用的基于特征模体来识别超家族的方法,引入单个氨基酸的物理化学性质(亲疏水性质)及其在氨基酸序列中的分布特征参数(分段的方法),利用最小离散增量算法对属于同一结构类的不同超家族进行了识别,总预测成功率令人满意.选取了全α类、全β类、α β类、α/β类中的各4个超家族分别进行了识别.对全α类的4个超家族,se lf-cons istency检验和jack-kn ife检验可达83.0%,81.2%;对全β类的4个超家族,两种检验均为80.9%;对α β类的4个超家族,两种检验总成功率最高分别为88.6%,88.0%;识别α/β类的4个超家族时两种检验的结果分别为69.3%和67.6%.
|
| 关 键 词： | 亲疏水 分段 离散量 最小离散增量 |
| 文章编号： | 1000-1638(2006)04-0416-08 |
| 收稿时间： | 2005-10-11 |
| 修稿时间： | 2005年10月11 |
Identification of the Protein Superfamilies by Using of the Least Diversity Increment Based on the Hydropathy Distribution of Amino Acids |
| |
| LIU Fen,LI Qian-zhong.Identification of the Protein Superfamilies by Using of the Least Diversity Increment Based on the Hydropathy Distribution of Amino Acids[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol,2006,37(4):416-423. |
| |
| Authors: | LIU Fen LI Qian-zhong |
| |
| Institution: | Department of Physics, College of Sciences and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | hydropathy segment diversity increment of diversity |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
|
