铁死亡相关lncRNA在神经胶质瘤的预后价值分析

通过分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库的神经胶质瘤患者的转录组数据与临床数据,应用基因共表达法、单因素Cox回归法筛选与预后有关的铁死亡相关长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),根据LASSO Cox回归分析与筛选出的lncRNA在样本中的表达情况,将样本分为高、低风险两组,通过单因素及多因素独立预后分析、受试者工作特征曲线(Receiver Operating Characteristic Curve, ROC Curve)、Kaplan-Meier生存曲线、风险曲线、基因富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)等方法评估铁死亡相关lncRNA在神经胶质瘤预后中的价值及临床意义,通过TIMER、CIBERSORT、CIBERSORT-ABS等方法分析免疫浸润情况,进一步对免疫功能、免疫检查点以及N6-甲基腺苷(m⁶A)甲基化差异进行分析。结果获得预后相关的铁死亡相关lncRNA共14个。单因素及多因素独立预后分析、ROC曲线结果表明,铁死...     

虎林盆地虎1井烃源岩评价及油源对比

对虎林盆地虎1井各层段泥岩地球化学指标进行评价,表明虎1井主要烃源岩层为虎林组一段和白垩系下云山组,两段源岩均为好烃源岩,源岩处于低熟到成熟阶段,具有较大的生烃潜力。通过原油与源岩的饱和烃色谱参数及生标化合物对比,发现虎1井原油为成熟原油,并具有陆相高等植物贡献生油的特点,与虎一段底部成熟烃源岩有较强的相似性,认为该井原油即来自于虎一段源岩。     

利用含氮化合物的分布探讨潜北周返断裂构造带的油气注入点

根据含氮化合物的分布特征,对周返断裂构造带各层位原油注入点位置与油气运移特征进行研究。结果表明:含氮化合物总含量在周11井到周13井之间呈现为高值,屏蔽型二甲基咔唑明显富集,1,8-/2,7-DMC等比值参数均有所增加,原油的注入位置位于周11井至周13井之间;以这两口井的区域为中心,洼陷内生成的油气向地层抬升方向上发生明显运移,表现出短距离侧向运移的特征,决定了研究区油气运移聚集模式主要为自生自储的成藏模式。     

潍北凹陷孔店组烃源岩生物标志物特征及地球化学意义

通过对潍北凹陷孔店组烃源岩有机质丰度、类型、成熟度及生物标志物的研究,发现孔店组烃源岩重排甾烷含量低,C27,C28和C29规则甾烷含量较多,C29甾烷的20S/(S R)和C29ββ/(ββ αα)比值分别在0.12～0.38和0.3～0.45之间;在萜类化合物中,奥利烷含量低,γ蜡烷与C30藿烷比值在0.1～0.37之间.研究结果表明孔店组烃源岩生源以高等植物为主,混有一定比例的藻类等低等水生生物,沉积环境为含盐度低的弱还原-弱氧化湖沼相,烃源岩有机质处于低熟-成熟阶段.     

我国第三系咸化湖相有机质组成及环境意义

针对中国新生代第三系广泛分布的咸化湖相盆地的成因及地球化学环境意义 ,比较系统地分析了中国新生界咸化湖相地层生油岩及原油中饱和烃、芳香烃等化合物的地球化学特征 .分析结果表明 :咸化湖地层中有机质的地球化学 (生物标志物组合 )特征 ,既不同于淡水湖相地层中的有机质 ,又与海相地层中的有机质存在明显的差别 .进一步讨论了造成这一现象的地球化学成因及其环境地球化学意义 ,并对其中部分生物标志物及稳定碳同位素组成特征的指相意义作了探讨 .通过生物标志物的组合特征和环境地球化学意义分析 ,初步认为中国新生代第三系咸化湖盆咸化湖泊的形成与海浸作用没有直接的联系 .     

Metabonomic analysis of hepatitis B virus-induced liver failure： identification of potential diagnostic biomarkers by fuzzy support vector machine

Hepatitis B virus （HBV）-induced liver failure is an emergent liver disease leading to high mortality. The severity of liver failure may be reflected by the profile of some metabolites. This study assessed the potential of using metabolites as biomarkers for liver failure by identifying metabolites with good discriminative performance for its phenotype. The serum samples from 24 HBV-indueed liver failure patients and 23 healthy volunteers were collected and analyzed by gas chromatography-mass spectrometry （GC-MS） to generate metabolite profiles. The 24 patients were further grouped into two classes according to the severity of liver failure. Twenty-five eommensal peaks in all metabolite profiles were extracted, and the relative area values of these peaks were used as features for each sample. Three algorithms, F-test, k-nearest neighbor （KNN） and fuzzy support vector machine （FSVM） combined with exhaustive search （ES）, were employed to identify a subset of metabolites （biomarkers） that best predict liver failure. Based on the achieved experimental dataset, 93.62% predictive accuracy by 6 features was selected with FSVM-ES and three key metabolites, glyeerie acid, cis-aeonitie acid and citric acid, are identified as potential diagnostic biomarkers.     

广西3种褐煤芳烃生物标志物组合特征

总结了广西三盆地３种第三系褐煤的多环芳烃特征，主要包括芳香倍半萜，二倍半萜和三萜类。其中以陆源奥利烷，乌散烷和羽扇烷前生物衍生而来的单芳于四芳三萜烃类为主，芳香二倍半萜，倍半萜次之 。     

microRNA: 一种潜在新型诊断结核病的生物标志物

为了阐述miRNA作为新型生物标记物在结核病诊断中的潜在应用的可能性和优势,文章对结核病的流行态势、诊断现状以及结核病中特异表达miRNA的研究进展了进行总结.结核病的高感染率、高死亡率及耐药菌株的出现严重威胁人类公共卫生事业.现有的结核病诊断技术无法满足快速、低成本、非侵袭性并易推广的诊断要求.miRNA作为一种新的诊断疾病的生物标志物已经在癌症、心脏疾病、妊娠、糖尿病、精神疾病以及多种感染性疾病等领域有研究.大量研究结果显示,在结核病人体内miRNA 21、miRNA 29a、miRNA 99b、miRNA 125b、miRNA 144和miRNA 144*、miRNA 155、miRNA 424表达上调,miRNA 142 3p、miRNA 146表达下调,而miRNA 223及miRNA let 7家族在结核病人不同部位表达存在差异.     

糖尿病早期预警肽类生物标志物的初步筛选

基于蛋白质组学策略结合¹⁸O标记技术,分析人血清白蛋白糖基化程度的糖尿病生物标志物筛选模型.基于HPLC-ESI/TOF MS的检测方法,筛选对葡萄糖敏感的人血清白蛋白酶切肽段.建立糖尿病监测及早期预警肽类生物标志物筛选模型,初步筛选出11个潜在的糖尿病早期诊断生物标志物.     

全脑辐照致神经损伤大鼠神经化学物质类生物标志物的筛选

为了对全脑辐照诱导神经损伤后的大鼠血进行外周血中神经化学物质类生物标志物的筛选,采用前期建立的血清中神经化学物质的化学衍生-超高效液相色谱-串联质谱分析方法,对不同全脑辐照剂量（0、10、30 Gy）和分次累积辐照（10 Gy×3）大鼠血清中42种神经化学物质的浓度进行了测定并进行了基于靶向代谢组学策略的统计学分析.单变量统计分析结果表明,辐照组（10、30、10 Gy×3）中去甲肾上腺素、乙酰胆碱、γ-氨基丁酸、酪胺、谷氨酸、酪氨酸、色氨酸、褪黑素、α-丙氨酸和甘氨酸的含量显著（p<0.05）低于对照组（0 Gy）,而乙酰胆碱和褪黑素的浓度变化趋势相反（p<0.05）.同时发现10 Gy×3组中神经化学物质含量的变化程度低于30 Gy组,表明分次累积辐照造成的神经化学物质扰动程度较同剂量的单次辐照低;通过结合多变量统计OPLS-DA模型分析中的变量重要性投影（VIP）值,本研究筛选出乙酰胆碱、谷氨酸、酪胺和褪黑素（p<0.05,VIP>1）可作为全脑辐照诱导神经损伤的潜在生物标志物.