RAPD技术在实验动物中的应用

随着生物医学的发展 ,实验动物种质资源的保护和利用、实验动物的标准化问题已成为当今实验动物科学发展的主题。实验动物遗传背景分析、品种或品系的鉴定、引种和繁育均需要一定的遗传标记辅助完成 ,分子遗传标记作为一种有效精确的监测手段 ,突破了形态学标记、细胞学标记和同功酶标记等表达型标记的局限性 ,可以从分子水平揭示物种的遗传变异 ,在许多领域发挥着独特的作用。RAPD技术是 1990年被首次提出 ,由于该方法具有简便、快速、成本低、信息含量丰富等特点 ,在生物类群种属分类鉴定、遗传图谱构建、物种亲缘关系的确定以及种群遗…     

Genetic analysis and molecular mapping of a presenescing leaf gene psll in rice （Oryza sativa L.）

A rice psl1 （presenescing leaf） mutant was obtained from a japonica variety Zhonghua 11 via radiation of ^60Co-γ in M2 generation. Every leaf of the mutant began to wither after it reached the biggest length, while the leaves of the wild variety could keep green for 25--35 d. In this study, genetic analysis and gene mapping were carried out for the mutant identified. The SSR marker analysis showed that the mutant was controlled by a single recessive gene （psl1） located on chromosome 2. Fine mapping of the psl1 locus was conducted with 34 new STS markers developed around psl1 anchored region based on the sequence diversity between Nipponbare and 93-11. The psl1 was further mapped between two STS markers, STS2-19 and STS2-26, with genetic distances of 0.43 and 0.11 cM, respectively, while cosegregated with STS2-25. A BAC contig was found to span the psl1 locus, the region being delimited to 48 kb. This result was very useful for cloning of the psl1 gene.     

利用SSR标记检测渗入普通小麦的冰草遗传物质

以日本普通小麦品种Fukuhokomugi为母本,以冰草（Agropyron cristaturn L．）为父本远缘杂交的后代再与其他普通小麦品种（系）杂交选育出8个遗传背景较复杂的小麦一冰草衍生种质材料。选取332对可扩增出冰草Z559特征带型的SSR引物,以8个小麦一冰草衍生材料及其所有亲本为模板进行PCR扩增。结果发现,13对SSR引物可分别在参试的所有8个小麦一冰草衍生材料中扩增出冰草z559的特异PCR产物,说明在这些材料中都含有冰草的外源染色体片段,即四倍体冰草Z559的遗传物质已经转移到了普通小麦的遗传背景中。     

SSR分子标记的开发策略概述

SSR分子标记是一种基于DNA重复序列长度多态性的分子标记技术,是进行群体遗传学结构分析、构建遗传连锁图谱非常有力的工具,应用该技术的前提条件是要有相应的SSR引物.综述了几种有代表性的SSR引物开发策略,旨在为各物种SSR标记的开发提供参考.     

硫酸二甲酯对毛泡桐丛枝病幼苗植原体及SSR扩增位点的影响

通过形态观察、巢式PCR和SSR分析,研究了不同浓度硫酸二甲酯(DMS)处理对毛泡桐丛枝病幼苗植原体及泡桐DNA的SSR扩增位点变化的影响。结果表明:质量浓度为15 mg/L的硫酸二甲酯处理5 h或质量浓度大于25 mg/L的硫酸二甲酯处理3 h以上仍成活的幼苗其形态上可转变为健康幼苗,但15 mg/L硫酸二甲酯处理5 h时形态健康的幼苗仍有丛枝病植原体的存在,而其余浓度处理后存活的幼苗内则检测不到植原体;质量浓度大于150 mg/L的硫酸二甲酯处理3 h以上的幼苗全部死亡。此外,毛泡桐丛枝病幼苗、健康幼苗和DMS处理后形态健康幼苗DNA的SSR扩增位点相同。     

系统地理学的研究及其在鱼类上的应用

介绍了系统地理学的研究内容、理论、方法,重点介绍了AVISE的5种物种分布模式、中性溯祖理论、mtDNA多态性分析的优越性以及TEMPLETON的巢式支系法。还从地理隔离、种群扩散、基因交流、区系划分、分子钟估算等方面阐述了系统地理学在鱼类的应用研究现况和应用前景。最后提出了系统地理学在鱼类应用时要注意的事项:1)要选择合适的基因DNA片段进行分析;2)mtDNA标记最好要与核DNA标记及形态学、细胞学、生化学标记结合使用;3)要提高分子钟估算的精确度。     

深圳梅林仙湖苏铁野生种群遗传多样性ISSR分析

仙湖苏铁Cycas fairylakeaD.Y.W ang是国家濒危保护植物,目前仅在我国广东省深圳市和曲江县发现有自然分布,个体总数已不足2 000株。本文应用ISSR标记对深圳梅林郊野公园仙湖苏铁野生种群的遗传多样性进行了研究。从100个引物中筛选出10个用于正式扩增,在14个个体中共检测到77个清晰的扩增位点,其中多态性位点67个,多态位点百分率为87.01%。根据所得数据求出的观察等位基因数为1.870 1,有效等位基因数为1.356 8,Ne i基因多样性指数为0.219 6,Shannon多样性指数为0.344 5。与其他苏铁类植物和濒危植物相比,仙湖苏铁仍然保持很高的遗传多样性水平。基于Jaccard相似性系数的UPGMA树系图表明,梅林郊野公园的仙湖苏铁个体明显地分为2个亚群,ISSR表型特征的主成分分析(PCA)也支持了聚类分析结果。研究结果对仙湖苏铁的保育和管理具有重要意义。     

Construction of an electronic physical map of Magnaporthe oryzae using genomic position-ready SSR markers

Magnaporthe oryzae is a model for plant pathogenic filamentous fungi. We have assembled a simple sequence repeat (SSR)-based physical map of the species, using in silico sequence data. A set of 120 SSR markers was developed from the genomic sequence of the reference isolate 70-15. These markers were readily amplified from the genomic DNA of other isolates, and high levels of allelic variation characterised the parental isolates of the two crosses tested. All the markers were locatable to one of the seven M. oryzae chromosomes. An SSR-based physical in silico map was constructed, and pre-existing SSR and RFLP loci were integrated into the map, along with 23 Avr (avirulence) genes and two other genes of importance to the plant/pathogen interaction. This map provides a platform for population genetics and functional genomics studies in the model pathogen, and even in other evolu- tionally related pathogens.     

小麦SSR标记的应用

SSR技术是建立在PCR技术上的新型分子标记,同其他分子标记相比,具有多态性高,重复性好、探作简单、结果稳定等特点.本文阐述了小麦SSR标记的技术路线,概括介绍了SSR标记在小麦中的应用.     

中国榛属植物DNA提取与SSR初步分析

为了探讨适合中国榛属植物基因组DNA的提取方法,分析榛属植物的遗传多样性,本实验以榛属植物的叶片为试材,通过对Doyle和Doyle方法的改良,摸索出适于中国榛属植物基因组DNA提取的方法,并以核酸产量、纯度、片断分布情况等指标来评价,获得高质量基因组DNA;同时应用4对欧榛SSR引物对中国榛属植物进行了跨种转移,并对具有商业潜力的平榛、毛榛和川榛3个种的遗传多样性进行了初步评价,4对引物从3个种的29个样本中扩增出33个等位基因,位点拥有的等位基因数量在6~12个之间,位点平均等位基因数为8.38.上述结果表明SSR是用于榛属种间育种、品种鉴定以及种间遗传图构建的有力工具.