线粒体蛋白组研究进展

线粒体蛋白组是指在线粒体中出现的所有蛋白质的集合,包括线粒体自身基因组编码的和 由核基因组编码的蛋白质.线粒体作为真核生物的重要细胞器,它参与去除氧化、产生能量和还原 性物质等等一些重要的生命活动过程.这些功能都依赖于线粒体蛋白组中的蛋白河的相互作用.要 对其有一个较为全面的认识,就必须对其蛋白组进行广泛且深入的研究.根据现有的一些研究成 果,对线粒体蛋白组在起源与进化、跨膜运输、研究方法和计算机预测作了简要综述.     

OFFGEL和LC-MS联用分析SH-SY5Y 细胞分泌蛋白质组

建立了游离胶分馏器(OFFGEL)和反相液相色谱质谱(LC-MS)联用分析SH-SY5Y细胞分泌蛋白质组的新方法.收集SH-SY5Y胞外蛋白用胰酶酶切成肽段后,用OFFGEL进行预分离并用LC-MS进行检测.用Mascot检索出88个蛋白,再通过生物信息学软件SignalP对Mascot检索的蛋白进行预测和筛选,共得到31种蛋白,用SingalP中的神经网络法和隐马可夫模型对其中的CERU_HUMAN进行分析,发现该蛋白是分泌蛋白,且信号肽的剪切位点在第19和第20氨基酸之间,软件SingalP提升了鉴定分泌蛋白的可靠性.     

HMGA1对肝细胞癌的增殖、迁移和细胞周期的作用影响

目的:探究HMGA1对肝癌细胞增殖、迁移及细胞周期的影响。方法:通过生物信息学、qRT-PCR、蛋白质印迹法分析HMGA1在正常肝组织与肝癌组织、正常肝细胞与肝癌细胞中的表达及其表达量与患者生存期的关系;通过GO和KEGG通路分析HMGA1及其相关基因在肝癌细胞生理活动中可能发挥的作用;MTT、克隆形成、Transwell实验及流式细胞术用于分析下调HMGA1对肝细胞癌的增殖、迁移、凋亡和细胞周期的影响。结果:与正常肝组织比较,肝癌组织HMGA1表达上调,且表达水平与患者生存期呈负相关;筛选得出451个正相关基因和398个负相关基因在TCGA-LIHC和GSE15765两个数据集中都具有统计学意义,KEGG和GO分析结果表明HMGA1及其相关基因参与组成细胞组分,并主要影响肿瘤细胞的分裂增殖、转录调控、氧化还原过程和代谢过程等;下调HMGA1抑制肝癌细胞的细胞活力、迁移,诱导细胞凋亡并阻滞细胞周期;敲低HMGA1使肿瘤体积缩小、重量减轻。结论:HMGA1可能作为原癌基因促进肝癌细胞的生长。     

白粉菌效应蛋白研究进展

在病原菌与植物的相互作用过程中,病原菌分泌大量效应蛋白帮助其侵染植物,因此效应蛋白一直是植物病理学研究的热点课题.该文基于大量白粉菌效应蛋白的研究成果,就近年来白粉菌效应蛋白的生物信息学预测分析结果、功能效应蛋白鉴定及其作用机理和无毒效应蛋白研究进展等方面进行综述,同时对未来值得重点关注的研究方向进行探讨,以期为白粉菌致病性的研究提供理论参考.     

蛇毒组学与抗毒素组学:蛋白质组学技术在抗蛇毒血清效价评估中的应用

蛇毒组学以蛋白组学研究方法为基础,实现了大规模解析蛇毒全蛋白组构成特征,为深度探讨蛇毒功能与进化提供了有力支持.为探索更为优化的抗蛇毒血清效价评估方法,以蛇毒组学为基础的抗毒素组学策略应运而生,极大地提高了评估结果的精准度与可靠性.文章主要介绍了蛇毒组学研究与相关策略的发展以及抗蛇毒血清效价评估方法的迭代,旨在为蛇毒组...     

遗传病分子诊断：新的进展和可预见的将来

随着分子生物学的进步，遗传病分子诊断在许多方面取得了显著进展，策略上的改善使我们有可能在分子水平上对多基因遗传病进行诊断；着床前诊断使有遗传病风险的夫妇有望获得完全正常的孩子；RNA诊断适用于检测基因表达的缺陷；着色FISH使染色体病的诊断更加准确可靠。得益于人基因组计划的成果，遗传病分子诊断将进入一个全新的时代。     

大鼠骨组织蛋白质组样品提取方法的建立

蛋白质组学是目前研究的重要热点．该拟建立大鼠骨组织蛋白质样品提取的最佳方法．用于双向电泳分离．为进一步进行蛋白组学分析奠定基础．实验对3种不同方法制备的样本进行同一条件的二维电泳(2-DE)图谱．比较2-DE的结果．结果发现，丙酮沉淀法最佳．这些结果提示．只有结合骨组织成分特征与双向电泳的具体要求．选择恰当的样品提取液．采用合理的提取步骤，获得蛋白质样品，才能得到清晰高分辨率的电泳图谱，满足蛋白质组学分析需要。     

复数小波变换在天蓝色链霉菌凝胶图像压缩中的应用

小波变换等多分辨分析方法能够处理图像配准中图像的全局和局部变形，小波变换在配准的同时还可以进行图像压缩，作为新近发展起来的多分辨分析方法，复数小波变换提供了移动不变性和方向选择性滤波器，在压缩比为40：1时，复数小波变换所实现的天蓝色链霉菌蛋白组凝胶图像压缩结果与离散小波变换结果十分接近。