武汉地区丙型肝炎病毒包膜蛋白E1的生物信息学研究

使用生物信息学的方法,分析武汉地区不同基因型、亚型的丙肝病毒的包膜E1蛋白,预测其二级结构、核苷酸变异性、糖基化位点、亲水性、跨膜区、信号肽、蛋白修饰位点、B细胞抗原.结果显示各HCV的包膜E1蛋白二级结构差距不大;序列始末段有数个氨基酸残基的差距,序列上存在高变异位点,基因型2a的型内一致性最高;序列大量糖基化,有多个糖基化基化位点;序列分布着亲水性区域,基因型1b的分值很高;基因型1b、6a、3b、3a多数亚型有1个跨膜区,基因型2a多数亚型有两个跨膜区;基因型1b、6a、3b、3a无信号肽,基因型2a都有信号肽;蛋白序列上存在多个不同修饰位点和B细胞抗原,各基因型、亚型之间有明显差距,具有较大异质性.该研究为揭示病毒感染机制和研制地区性疫苗提供一定的科学依据.     

Using maximum likelihood method to detect adaptive evolution of HCV envelope protein-coding genes

The basic process of adaptive evolution by natural selection is the replacement of one allele gene by an- other with a higher fitness in a population. Detecting the adaptive evolution would be helpful for better un- derstanding of bio-evolutionary mechani…     

应用最大似然法检测丙肝病毒包膜蛋白编码基因的适应性进化

非同义-同义置换速率比值(d_N/d_S)是藉蛋白质编码序列评价选择压力的一种重要测度, 而基于密码子置换模型的最大似然法业已成为检测承受正选择的氨基酸位点及适应性进化的统计分析工具. 本研究应用最大似然法分析了丙型肝炎病毒的包膜蛋白编码序列, 从全世界18个常见的基因型/亚型中, 发现了4个正选择/适应性位点. 由于这些氨基酸位点位于不同的免疫表位, 本研究结果具有潜在的生物医学价值, 同时表明最大似然法可以作为一种检测高分歧度病毒蛋白中适应性进化存在与否的有效手段.     

人类乙型肝炎样病毒Pre—S1包膜蛋白的一个特定区域为乙肝病毒形成所必需

土拨鼠肝炎病毒（WHV）是一种哺乳类动物的肝炎病毒．这种病毒在结构和抗原怕与人类乙型肝炎病毒（HBV）非常相似．以往的研究报告指出,在一种称为鸭乙型肝炎病毒（DHBV）的Pre－S包膜蛋白中,含有一个特定区域．这一区域由天冬氨酸－天冬氨酸－脯氨酸－亮氨酸－亮氨酸（DDPLL）5个氨基酸残基所组成．已发现,这一区域在像DHBV这一类禽类乙肝病毒的病毒装配和分泌时所必需的（LenhoffR,SummersJ．JVirol,1994,68：4565～4571）．在WHV的Pre－S包胰蛋白中第201个氨基酸到第205个氨基酸所包含的顺序,甘氨酸－天冬氨酸－脯氨…     

存在争议的读脑术

正一种新的技术将小鼠的大脑制作成透明的3D大脑,这使得科学家能够清楚地观察到大脑中的神经细胞乃至分子结构。这一技术在得到改进和完善后很可能应用到人类身上。MRI不够清晰2013年4月,美国总统奥巴马宣布美国将进行一个宏伟的科学研究计划——人脑研究计划。9月中旬,美国国立卫生院公布了脑计划9个获得国     

丙型肝炎病毒包膜蛋白E2与CD81关系的研究进展

丙型肝炎病毒(HCV)是慢性肝炎的主要病因之一，其基因组为单股正链RNA，包膜蛋白殴在HCV入侵宿主细胞中起重要作用，CD81可能是HCV的受体或共同受体，进一步研究CDSl和HCV的相互作用，有助于HCV的治疗和预防。