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随着鱼类水产养殖业的不断发展,亟需对一些重要的养殖种群进行遗传性状的改良和良种的选育,而分子标记技术可以大大加快良种选育和性状改良的的过程。作为第三代的分子标记技术,SNP分子标记在一些实际应用当中体现出了比微卫星技术更优越,例如遗传稳定性高、高密度、便于自动化分析等优点。目前SNP在鱼类应用中比较少,因此有必要对SNP在鱼类养殖中的发展现状进行总结,这将对于后期SNP分子标记技术养殖中的发展起到推动作用。 相似文献
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舟山普陀海域的渔业资源丰富,为鱼类多样性研究提供了独特的优势。碜是经济价值很高的海洋鱼类,普遍分布于热带,亚热带和温带海域,常栖息于普陀沿海海域。本文采用线粒体COI DNA序列,对来自普陀海域18尾鲹的样本进行分子条形码和物种多样性分析。结果显示,共有12个单倍型,分别隶属于7属8种,其中3种在该海域首次纪录。此外,结合GenBank的序列数据,共获得12属18种鲹的COI DNA同源序列,并构建了NJ与Bayesian聚类树。通过聚类关系,各物种的进化关系及其分类地位可以直观地显示出来。DNA条形码弥补了传统分类学在鲹科鱼的命名及分类归属上的不足,从而增进人们对够科鱼在舟山普陀海域物种多样性的了解,为当地养殖业及海洋保护提供科学理论框架。 相似文献
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通过对浙江沿岸41个髭缟虾虎鱼样本579 bp线粒体DNACOI序列进行分析,共鉴定出11种单倍型。单倍型之间碱基替换为1~5个。H01是最常见单倍型(占总数的56.1%),被23个个体分享,分布于6个采样点;H02分布于除象山之外的5个采样点;洞头、临海分享了H03;H06和H07仅分布在嵊泗;H08和H09仅分布在岱山;H10只分布在象山;H11只分布在苍南。单倍型多态性与核苷酸多态性在嵊泗最高(Hd=0.90±0.16;π=0.003 1±0.000 7),在临海最低(Hd=0.57±0.13;π=0.001 3±0.000 4)。这可能与嵊泗列岛栖息地生态环境多样性,或者较少人为活动干扰有关。单倍型网络图呈辐射状,以H01和H02为中心,通过1~3个碱基替换与其它所有单倍型相连接,除此之外,NJ聚类树、AMOVA和FST分析结果一致表明,浙江沿岸髭缟虾虎鱼没有显著的系统地理分化。初步推断有两种可能:(1)不同群体间的隔离时间不久;(2)该海域没有显著的基因流障碍。此外,台湾暖流与沿岸入海径流的交汇,有助于海洋生物卵、幼体及成体的扩散,导致了髭缟虾虎鱼群体间的遗传结构不显著。 相似文献
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用PCR(多聚酶链式反应)扩增方法测定白头叶猴、黑叶猴和菲氏叶猴各1只的线粒体DNAND4整个基因(1377bp)和D-环500多bp序列。黑叶猴与菲氏叶猴的ND4基因序列碱基差异数高达123,基于ND4基因的遗传距离值为8.9%;白头叶猴与黑叶猴ND4基因序列间碱基差异数为25,遗传距离值为1.8%。在D-环区域,白头叶猴与黑叶猴间的遗传距离为4.3%,而白头叶猴、黑叶猴两者与菲氏叶猴间的遗传距离则分别高达26.4%和26.0%。分析结果表明,白头叶猴恐怕还只是黑叶猴的一个亚种。从保护遗传学角度看,白头叶猴应被看作一个进化显著性单元(evolutionarysignificantunits,ESU),在动物的保护行动中应得到充分的重视 相似文献
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