中华补血草金属硫蛋白基因的克隆及高盐处理下的表达模式分析

以中华补血草叶片为材料,提取其总RNA并反转录cDNA,并以cDNA为模板,克隆得到包含该基因完整开放阅读框的cDNA序列,序列分析表明,该基因开放阅读框长249 bp,编码82个氨基酸;该蛋白含有14个半胱氨酸,主要分布在蛋白质的N端和C端,呈CC,CX,CXXC形式排列.预测该蛋白分子质量为8 133.1 D;等电...     

中华补血草LsRab7基因的克隆及盐、干旱胁迫下表达分析

利用RT-PCR技术从中华补血草中获得了LsRab7基因的cDNA序列,利用NCBI ORF founder分析表明,该基因包含1个618 bp的开放阅读框,编码含205个氨基酸残基的蛋白质,利用ExPASy服务器预测其相对分子质量为22 849.95,理论等电点为5.67.qRT-PCR分析结果表明,在盐处理或干旱处理条件下,在一定时间内LsRab7基因的表达水平均有升高,说明LsRab7可能参与中华补血草的抗逆反应过程,为探究中华补血草的抗逆分子机制奠定了一定的基础.     

藜麦热激蛋白60(CqHSP60)基因家族生物信息学和表达模式分析

为了探究藜麦HSP60基因(CqHSP60)的结构特征、基因功能和表达模式,基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学方法对CqHSP60基因家族进行鉴定和系统分析。依据亚细胞结构定位分为了三个亚组,每个亚组具有相似的Motif和基因结构;通过RNA-Seq数据对CqHSP60基因在不同发育阶段进行了表达分析,并对在热、干旱、盐胁迫等不同处理条件下CqHSP60基因的胁迫响应进行了分析,结果表明CqHSP60基因在花簇和干种子中表达量较高,并对不同的胁迫模式均有响应;在CqHSP60基因的启动子区发现了多个与胁迫相关的顺式调控元件,这表明这些基因在多重胁迫下受到应激响应。