代谢网络的重构

在已有的构建代谢网络方法的基础上,提出了构造代谢网络的改进方法.以鱼腥藻作为实例,利用KEGG数据库中生物体的生化反应、酶、基因数据重构出鱼腥藻的初步代谢网络,并对初步代谢网络进行了修正,讨论了该网络的拓扑结构性质.     

中国大学关系的复杂网络

采用14个参量描述大学状态,这些状态间的余弦距离定量描述各大学之间的相似性,得到最小生成树.每个大学与最相似的若干大学连接,得到描述大学关系的复杂网络.度、介数、紧密度和社区结果等拓扑概念用于讨论这些网络的非平凡结构特点.中国大学(不含港澳台地区院校)划分为12个社区,每个社区内度最大的节点作为社区标志,而社区间邻接的介数最大的点作为边界.发现边界是排名在前列的具有强竞争力的高校,表明"综合化"是大学提高竞争力的努力方向.紧密度小的边界和各社区标志大学可作为中国大学代表,可供综合评价大学教育体系参考.     

基于基尼系数的网络结构洞测量

用结构洞分析网络结构是评价网络结构引起的竞争优势的一种重要方法.本文提出了一种新的结构洞定量描述方法,即基于主成分分析(PCA)的结构洞的测量.给出了类似于基尼系数的网络贡献度的概念,在满足度分布不变的条件下利用贡献度分析对比无标度网络与对应的随机网络,证实用贡献度评价网络有效性的优越性.得出结论:贡献度S越大,说明网络中每个节点的重要性越平均,结构洞程度越大;反之,贡献度S越小,则说明网络结构信息主要集中在部分节点上,结构洞程度越小.