雷蒙德氏棉DNase Ⅰ高敏感位点(DHSs)文库构建方法

染色质DNA对DNase Ⅰ表现出高敏感性的位点(DNase Ⅰ hypersensitive sites,DHSs)多是顺式作用元件所在的位置,包括启动子、增强子、调节子和衰减子等.研究DHSs位点的数目及其动态变化是探明顺式作用元件功能、揭示基因表达调控机制,乃至进行基因编辑和创新遗传材料的重要辅助手段.本文借鉴水稻和拟南芥DHSs文库构建方法,通过优化设计,初步建立了二倍体雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii D5)的DHSs文库,为深入进行棉花功能基因组研究奠定基础.     

棉花45S rDNA内转录间隔区的克隆与分析

45S rDNA的内转录间隔区(Internal transcribed space, ITS)序列变异性强，是被广泛应用于物种间进化关系研究的序列标签.通过克隆艾克棉(Gossypium ekmanianum,AD₆)、斯蒂芬斯棉(Gossypium stephensii,AD₇)、异常棉(Gossypium anomalum,B₁)、戴维逊氏棉(Gossypium davidsonii,D_3-d)、克劳茨基棉(Gossypium klotzschianum,D_3-k)、旱地棉(Gossypium aridum,D₄)6个棉种的ITS序列，首次获得新鉴定的2个四倍体棉种艾克棉和斯蒂芬斯棉的ITS区序列信息，补充了异常棉、克劳茨基棉和戴维逊氏棉3个棉种ITS区序列的未知碱基.基于ITS序列信息构建了涵盖A,B,C,D,E,F,AD 7个基因组的棉属系统发育树，确定了新鉴定的2个四倍体棉种进化地位，探讨了棉属亲缘关系.研究结果补充和完善了棉属ITS序列信息，...