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通过同源建模,得到Ⅰ型抗癌晶体蛋白Parasporin-1的初始三维结构经分子动力学方法优化后,利用Ramachandran Plot检测和结构匹配等方法对模型进行评价.结果显示,结构模型中的键长、键角及二面角的分布合理,与模板蛋白的主链α碳原子的均方根差值为0.537 592, 在合理范围之内.此外,通过分析Parasporin-1结构域Ⅰ中的β-loop-β结构片段,推测出第2个蛋白酶处理激活位点的位置在两个芳香族疏水性氨基酸F167与Y168之间. 相似文献
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