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探讨了一种新的诱导化学键偶极计算方法并确定了相关参数,并将其应用于计算质子化精氨酸侧链或质子化精氨酸片段与水分子形成的团簇的二体和三体相互作用能.通过与已有的AMOEBAbio18方法进行比较,发现新方法在预测团簇相对稳定性方面表现出了良好的性能,且在计算效率上具有明显优势.此外,该方法在其他随机团簇的相互作用能计算中也展现了令人满意的准确度.总的来说,本研究为分子模拟和计算化学领域提供了一种可靠的计算方法,有望在药物设计和生物化学研究中具有广泛的应用前景. 相似文献
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槲皮素是一种具有较好抗肿瘤作用的黄酮类化合物.研究槲皮素与生物分子间的相互作用对药理学和新药的研发工作有着重要的意义.基于这一理念,在M06-2X/6-311++G(d,p)水平研究了甲基化的腺嘌呤、甲基化的胸腺嘧啶和甲基化的尿嘧啶等模型分子与槲皮素分子间的相互作用.通过计算槲皮素分子与模型生物分子间相互作用能并与相应的Watson-Crick型碱基间相应能量进行比较,从理论上初步探讨了槲皮素分子干扰核酸生物合成这一抗癌机制的可能性.研究结果表明:槲皮素分子QU1,QU2和QU5位点与碱基腺嘌呤之间的相互作用强度较强.从理论上讲,该分子可以实现对基因的复制或表达等过程的干扰.从这一角度讲,槲皮素分子具有阻断细胞繁殖、干扰遗传信息表达的作用. 相似文献
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