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以487份菠菜材料为研究对象,对5个耐抽薹指标进行相关性分析、主成分分析、隶属函数法和聚类分析,综合评价了菠菜的耐抽薹性. 研究结果表明:各指标的频数分布基本符合正态分布. 菠菜在上海地区抽薹和开花启动的时间为10~13 h,越耐抽薹,抽薹开花启动的时间越长. 相关性分析结果表明:抽薹期、开花期、抽薹昼长和开花昼长存在极显著正相关. 主成分分析将5个指标转化为2个主成分因子,累计贡献率达到99.5%. 用隶属函数法将487份材料划分为5个等级,并筛选出12份极耐抽薹材料. 用聚类分析将487份菠菜材料划分为5个类群,其中第Ⅳ类群为极耐抽薹材料,说明隶属函数法和聚类分析均可以有效地评价菠菜的耐抽薹性. 最后筛选出10份极耐抽薹材料US175,CS105,CS120,CS121,CS175,CS232,CS253,CS256,CS257和S14,可应用于菠菜耐抽薹材料创制或新品种选育. 相似文献
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以现有菠菜基因组信息为基础,通过生物信息学方法筛选鉴定16个菠菜SoSWEET蛋白家族成员,命名为SoSWEET1~SoSWEET16.氨基酸残基数量在648~1 140之间,分子质量在54 070.32~95 868.64 u之间,理论等电点(pI)在5.06~5.19之间.亚细胞定位预测有6个SoSWEET蛋白定位于细胞膜,5个SoSWEET蛋白定位于内质网,5个SoSWEET蛋白定位于细胞膜、内质网.系统进化分析将菠菜SoSWEET蛋白家族分成4个亚族,在此基础上对基因结构、保守基序、顺式作用调控元件等进行分析.共鉴定了10个高度保守基序,其中所有菠菜SoSWEET蛋白都包含基序1,2和4,是构成菠菜SoSWEET蛋白中最高度保守的部分.所有菠菜SoSWEET蛋白家族成员都含MtN3_slv和PQ-loop superfamily结构域.大多数SoSWEET蛋白家族的基因含有5个内含子.顺式作用元件预测结果表明,菠菜SoSWEET基因启动子上包含光响应、生长发育、植物激素响应和逆境胁迫响应等顺式作用元件.组织表达分析表明,所有SoSWEET基因在根、茎、叶和叶柄中都有表达,霜霉病胁迫处理后16个基因表现出不同响应变化.本研究为后续深入研究菠菜SoSWEET蛋白家族成员的功能提供了重要参考. 相似文献
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