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一种以测序为基础的基因分型方法的建立 总被引:5,自引:0,他引:5
设计了一种自动化的基因分型方法,能够直接利用PCR产物的DNA测序结果作为数据,通过自动化基因分型程序(automatic genotyping program)与一个含有其等位基因序列的数据库进行比较,来完成高精度的基因分型工作。用这种方法对50个随机挑选的中国南方人的HLA-DPB1基因进行了基因分型,证明该方法是可行的,并从中发现了2个不明确杂合子以及一个新的等位基因序列。随后对这些样品克隆测序,发现除了2个不明确杂合子得到了 进一步的区分外,其它样品都与前面的分型结果一致,显示了96%的精确性。通过以上的研究表明,成功建立了一种高精度的、基于序列的分型(sequence-based typing)方法。既然该方法能成功分型HLA-DPB1基因,预示了该方法同样能应用于其它基因的分型。该AGP程序可以在http:/genome.zsu.edu,cn免费下载。 相似文献
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从Aspergillus niger CICC 40179中克隆得到了葡萄糖氧化酶(GOD)基因,并在酿酒酵母AS2.489中通过载体p2μRCMB进行重组表达.合成来源于A.niger的一段GOD基因(美国专利号为5094951),同时对其进行了少量密码子的同义替换以避免部分酶切位点,将该段合成的序列通过甲醇诱导型载体p PICZαA在毕赤酵母X33中进行了重组表达.比较分析两种葡萄糖氧化酶的分泌表达情况. 相似文献
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