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HD9802-9S是以HD9802S为母本、以固优12为父本杂交选育的一个温敏核不育系。人工气候箱鉴定该不育系转育起始温度高于HD9802S,表明HD9802-9S和HD9802S两个品系的育性调控基因有差异。构建HD9802-9S/R446 F_2群体和HD9802-9S/R144 F_2群体,每个群体中随机选择100个不育单株和100个高度可育单株分别构建可育混池和不育混池进行BSA重测序。统计并计算每个BSA重测序结果的ΔSNP-index值,并以95%和99%置信水平作为筛选的阈值。高于95%置信水平的ΔSNP-index定位于2号染色体上总长为3. 24 Mb的候选区域和7号染色体上0. 69 Mb长度的候选区域内;高于99%置信水平的ΔSNP-index定位于2号染色体上总长为1. 87 Mb的候选区域内,在7号染色体上没有候选SNP,两个群体的定位结果相同。因此,HD9802-9S的不育主效基因定位在2号染色体,7号染色体上可能存在其他控制育性的QTL位点。HD9802-9S的2号染色体上存在64个控制花粉育性表达的候选基因。这些结果为进一步研究它们与tms5之间的关系奠定基础。 相似文献
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水稻OsGATA家族第Ⅶ亚家族基因OsGATA23有两个成员,其中一个成员OsGATA23a是多应激反应转录因子,在盐碱度ABA处理和干旱条件下高度表达.利用生物信息学技术,从核酸和蛋白层面分析OsGATA23a亚基在非生物胁迫下显著表达,OsGATA23b亚基在该胁迫下不表达或低表达的影响因素.结果表明,OsGATA23基因的两个亚基蛋白结构的稳定性不同引起表达不同.首先,运用生物信息学技术对GATA23的蛋白性质、功能、结构进行分析;其次,对启动子顺式作用元件进行统计分析.比对水稻OsGATA23基因亚基及亚基差异氨基酸序列的理化性质发现OsGATA23a-1蛋白结构比较稳定.OsGATA23a平均亲水系数为0.327,该段氨基酸序列疏水.OsGATA23a-1氨基酸序列段存在信号肽位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化活性位点,而OsGATA23b-1不存在.在OsGATA23a-1中α螺旋显著减少,延伸链显著增加.OsGATA23b-1中α螺旋减少,无规则卷曲显著增加.对OsGATA23a和OsGATA23b蛋白三级结构模拟发现其亚基结构组成大致相似,对OsGATA23a-1、OsGATA23b-1蛋白三级结构模拟时,发现OsGATA23b-1在计算机算法上不存在稳定的三级结构构象,而无法模拟.OsGATA23基因启动子序列正反链上存在较多与逆境、根等相关的顺式作用元件.在非生物应激状态下,上游相关顺式作用元件选择性识别下游基因OsGATA23成员中具有比较稳定的疏水蛋白结构OsGATA23a亚基,同时在OsGATA23a-1存在信号肽位点,说明OsGATA23a-1不仅有利于OsGATA23a亚基蛋白结构的优化,而且还能被特异性识别.OsGATA23b亚基在逆境状态下不表达或低表达,说明OsGATA23b-1不利于OsGATA23b亚基蛋白结构稳定,且不能被特异性识别. 相似文献
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