Notable diversity in hemoglobin expression patterns among species of the deep-sea clam, <Emphasis Type="Italic">Calyptogena</Emphasis>

The deep-sea clams Calyptogena nautilei and C. tsubasa, which live in the cold-seep area at a depth of 3570 m in the Nankai Trough, Japan, have abundant hemoglobins (Hbs) in erythrocytes, similar to other Calyptogena species. We determined the cDNA-derived amino acid sequences of Hbs from two Calyptogena species. C. tsubasa was found to contain two dimeric Hbs, Hb I consisting of 145 amino acid residues and Hb II with 137 residues, similar to known Hbs from C. soyoae and C. kaikoi. Sequence identity was over 90% among the orthologous chains of Calyptogena Hbs. On the other hand, surprisingly, C. nautilei contained two monomeric Hbs, Hb III containing 141 residues and Hb IV with 134 residues. In addition, Hbs III and IV showed only 33–42% sequence identity with Hbs I and II from other Calyptogena species. The distal (E7) histidine, one of the functionally important residues of the heme protein, is replaced by glutamine in all Hb chains of Calyptogena species. A phylogenetic analysis indicated that C. nautilei Hb III is closer to Hb I from other Calyptogena species. We suppose that a Hb gene was duplicated at least three times in an immediate ancestor of Calyptogena and, presumably depending on physiological conditions different Hb sets are being expressed: dimeric Hbs I and II in C. soyoae, C. kaikoi and C. tsubasa, and monomeric Hbs III and IV in C. nautilei. Received 13 May 2003; received after revision 5 June 2003; accepted 12 June 2003     

概念组织进化:图尔明对科学理性问题的解决

现代西方科学哲学从上世纪二三十年代的逻辑经验主义向当代的自然主义与实践哲学的转变,背后实现的是对逻辑经验主义的理论预设的超越。就范导这一超越所遵循的路线和依据而言,图尔明的超前于科学哲学主流的工作占有独特地位。     

投影寻踪动态聚类模型

投影寻踪聚类模型在多因素聚类分析中被广泛应用并取得了满意的效果,然而,该模型还存在诸如密度窗宽参数取值经验确定等不足,有待改进提高.本文针对投影寻踪聚类模型的不足,首次把投影寻踪的思想和动态聚类方法结合起来构造投影指标,基于免疫进化算法,建立了投影寻踪动态聚类新模型.新模型一方面在整个运算过程中毋需人为给定参数,聚类结果客观、明确,另一方面,它还具有稳定性好、操作简便等特点.洪水分类的实际应用表明,投影寻踪动态聚类模型切实可行,取得了很好的效果,在多因素聚类分析领域具有广阔的应用前景.     

对科技创新促进产业创新的哲学探析

科技创新与产业创新二者皆具生态进化特性，科技创新促进产业创新在区域内具有其内在的一些表征：共生进化的统一性、投资的高风险性、区域产业发展的非平衡性等。科技创新在产业创新上的价值体现不仅是其本身的表现，还负荷着科学精神、科技创新文化等内在的价值作用。科技创新促进产业创新，产业创新为科技创新增活力。不断优化区域科技创新的环境与系统。提高以自主创新的核心创新能力，促进与产业创新的共生进化与优化。     

一个快速进化的microRNA家族

microRNAs(miRNAs)是长约22nt的非编码RNA,它可通过降解mRNA或抑制其翻译来调控基因。本文简要介绍了miRNAs的研究背景,阐述了通过比较近缘物种中非保守的miRNA基因来研究miRNAs分子进化的理由。我们的研究结果证实miRNA基因会受到达尔文正选择的影响,发生快速的进化。这一结果将为我们了解非蛋白编码基因的功能与进化提供崭新的视角。     

武器装备体系结构演化仿真研究

受经费和生产能力的限制,武器装备建设过程呈现渐进发展的特点。科学的建设计划方案成为实现武器装备体系结构优化的重要条件。从武器装备的体系层次出发,提出了武器装备体系结构演化仿真的概念,明确了体系结构演化仿真的使命任务及总体思路。在分析了武器装备体系演化过程的主要影响因素、确定了基本优化思路的基础上,提出了体系结构演化仿真的优化指标。最后,从顶层设计的角度提出了软件系统的功能模型。     

采矿岩体动态稳定性CA模型的建立与系统分析

运用元胞自动机的演化建模方法构建深部采矿岩体的动态稳定性演化模型.定义岩体的工作状态变化概率和岩体完整性影响系数,创建了一种实现采矿岩体的动力学仿真模型.通过数字模拟实验,分析了岩体中不同状态下的元胞相互作用的关系,得到了以离散度作为岩体动态稳定性的度量指标.     

一种基于混合差分策略的改进差分进化算法

对启发式优化算法中的差分进化算法进行改进,在进化过程中并行交叉采用DE/rand/1/exp和DE/best/1/exp差分策略,应用聚集度因子进行种群重构,缩小了种群重构后的搜索范围,有效避免了种群重构的随机性.仿真结果表明,改进算法与使用单一差分策略的差分进化算法及PSO算法相比,寻优能力得到了显著提高.     

基因组学领域演进的科学计量研究

该研究分析了当前生命科学中最具理论与应用价值的研究领域基因组学1991 — 2006 年在知识维
度上的演进过程。研究以Web of Science 数据库的论文数据为基础，对基因组学领域高频关键词的共现
矩阵进行了分析：三个不同时间段的多维尺度分析表明，处于不同发展阶段的关键词之间亲疏关系存在规
律性特征，对这些特征的分析进一步可以揭示该领域目前所处的发展阶段；此外，不同阶段共现矩阵的因
子分析展现了研究主题在时间轴上的变迁。数据分析表明：利用科学计量方法对基因组学演进过程进行研
究可以挖掘大量有用的信息。     

一种十进制自适应并行遗传算法

针对遗传算法中的早收敛现象,从增强和保持种群多样性出发,引入自适应并行遗传算子的进化策略,提出了一种十进制自适应并行遗传算法(Decimal Adaptive Parallel Genetic Algorithm).实验结果表明,该算法对多个标准测试函数都表现出较好的搜索性能.