利用复杂网络来研究tRNA序列的进化

根据点突变和互补复制的进化机制构建tRNA序列相似度平行网络和反平行网络并研究了网络的特征.分析发现当相似度很大时,tRNA基因网络出现了无标度(scale-free)的特征.其次,还比较了平行网络和反平行网络的特征,发现在相同的条件下,反平行网络中的tRNA序列间的关系比平行网络中更密切,它们之间的相似程度更高.这同时说明现代tRNA 序列由互补复制机制进化的可能性更大.最后根据点突变和互补复制的进化机制建立了一个粗糙的tRNA进化模型.结果发现模型tRNA相似度网络在0.3≤ξ≤0.5条件下,不仅和真实tRNA相似度网络有局部的相似行为,而且网络的整体行为也是相似的.因此现代tRNA序列的合理的进化机制应该是上述两种机制的混合.     

植物谷胱甘肽转移酶和盐胁迫

谷胱甘肽转移酶 (GSTs)的种类不一 ,在植物异生代谢和内生代谢中都表现了一定的功能 ,通过转基因技术使之在植物体中过量表达显示它在植物耐盐过程中也起到了一定的作用 .     

人胎盘G—蛋白ab3a cDNA的克隆

为了获取全长的小分子G－蛋白Rab3a，以用于研究Rab3a与其他蛋白相互作用关系，本实验以人胎盘总cDNA为模板，PCR扩增到人Rab3a cDNA全编码区。产物回收后克隆于质粒pYESTrp2的BamHI/Xhol位点，测序结果表明，本实验获得的Rab3a cDNA包含了起始和终止密码子。与PCR引物设计的参照Rab3a比较有5个核苷酸变异，与翻译的氨基酸序列完全一致。由此表明本实验获得的Rab3a cDNA可用于进一步研究。     

水稻线粒体tRNATrp的种属特异性氨酰化

为了研究原核生物和真核生物（细胞质）色氨酰tRNA合成酶（TrpRS）对线粒体tRNA^Trp识别的种属特异性,构建了7个水稻线粒体tRNA^Trp三位点（G73,U72,A68）的单点或多点突变的突变体．这些突变基因,经体外转录后分别用枯草杆菌（B．subtilis）和人色氨酰tRNA合成酶（TrpRS）进行氨酰化反应,并测定它们的动力学常数．结果表明,与野生型水稻线粒体tRNA^Trp相比,7个突变体的转录产物被B．subtilis TrpRS氨酰化的活力分别降低了53．33％-99．79％,被人TrpRS氨酰化的活力却分别提高了4～330倍,其中以MPH7（水稻线粒体tRNA^Trp的三碱基（G73,U72和C68）全部突变为人tRNA^Trp的三碱基序列）的氨酰化活力改变最大．实验结果证明,与真核生物和原核生物细胞质tRNATrp的种族特异性类似,水稻线粒体tRNA^Trp的种属特异性元件也主要处于氨基酸接受茎的识别位碱基、第一和第五对碱基对,亦即识别位碱基G73,氨基酸接受茎上的两个碱基对G1／U72和U5／A68．本研究为线粒体tRNA^Trp起源于真细菌的推论提供了实验依据．     

种群间遗传距离与进化趋异

遗传距离是衡量种群间遗传分化程度和差异大小的数量指标。近年来,不仅在生物进化与物种形成方面,而且在分类学、生态学、人类学等很多领域都有广泛的应用。同时,在人类遗传研究中也受到越来越普遍的注意。本文阐述遗传距离的概念、估算原理及其应用,并将其与蛋白质变异有关的等位基因差异联系起来。在此基础上讨论最小遗传距离D_(min)、标准距离D和最大距离D_(max)的概念与公式。并结合实例进行分析与释义。     

胰岛素抵抗及高血糖对GFAT活性的影响

分别观察了胰岛素抵抗和高血糖水平对己糖胺途径限速酶GFAT活性的影响.在alloxan高血糖小鼠模型中,与正常对照组比较,血清果糖胺水平升高了15.9%,肾组织GFAT活性升高了32.8%;经胰岛素治疗后,血清果糖胺水平降低了9.7%,其肾组织GFAT活性也降低了l9.4%.在高糖高脂饲料诱导的胰岛素抵抗的IR小鼠中,与同批正常对照组比较,正糖钳实验中稳态时葡萄糖输注率G IR值降低了69.3%,胰岛素耐量实验中的AUC值升高了38.1%,其肾脏组织GFAT活性也增加了26.6%.在胰岛素诱导的具有胰岛素抵抗的IR-H IR c细胞模型中,与正常H IR c细胞比较,其10、25 nmol/L胰岛素诱导的葡萄糖摄取能力分别降低了25.3%、21.1%,而GFAT活性分别增加了29.7%、46.5%.可见,GFAT活性与一段时间的平均血糖水平和胰岛素抵抗状态密切正相关.     

“它带来的变化是基本的和颠覆性的”

●60年前,DNA双螺旋结构的阐明对于分子生物学的诞生具有里程碑意义,并由此促发了生命科学领域一系列革命性的变化。DNA的遗传信息得以完整地传递到下一代是因为DNA分子自身复制的一种半保留机制。DNA双螺旋结构是由两条方向相反的多聚核苷酸链相互缠绕构成的,这两条链所携带的遗传信息相当于镜像关系,不管保留哪一半,它都能复制出另一半。这     

荧光法测定Ce^3＋与tRNA的结合常数

与其它稀土离子的自身荧光相比,稀土Ｃｅ３＋水合离子的荧光要强得多,并且在很宽的浓度范围内与其浓度成很好的正比关系,因此可以用来确定Ｃｅ３＋离子的浓度．ｔＲＮＡ非常强烈地猝灭Ｃｅ３＋水合离子的荧光．采用荧光滴定的方法研究了Ｃｅ３＋－ｔＲＮＡ体系,并用Ｓｃａｔｃｈａｒｄ方法测量了Ｃｅ３＋离子和ｔＲＮＡ的结合数和结合常数,结果发现：ｔＲＮＡ中有２组Ｃｅ３＋结合位置,其结合常数分别为约１０８ｍｏｌ／Ｌ和１０５ｍｏｌ／Ｌ．向体系中加入精胺可使结合数和结合常数稍微降低．     

邻菲啰呤和核苷酸对Tb(Ⅲ)的协同荧光增强效应(英)

对邻菲囉呤(Phen)存在下16种核苷酸对Tb(Ⅲ)荧光的增强效应进行了系统研究。根据I/I_0值(I和I_0分别为有和无Phen存在时体系的荧光强度)的大小可把这16种核苷酸分为3种类型:(1)对腺瞟啉核苷酸,I/I_0值在150—230之间,这就使得用该体系来研究腺苷酸与Ca和Mg离子间的作用成为可能;(2)对嘧啶碱基核苷酸类,I/I_0值在10—50之间,(3)鸟嘌啉核苷酸类,I/I_0值大约为0.8。我们发现Phen和核苷酸对Tb(Ⅲ)的荧光增强具有协同效应,这种协同效应可能是由于Phen和核苷酸芳环之间的疏水相互作用肥Phen限定在距Tb(Ⅲ)较近的范围内,因而增强了能量转移的效率及荧光强度。     

分子力学方法在核苷酸十二聚体结构问题上的应用

具有序列d(CGCGAATTCGCG)和它的衍生物的核苷酸十二聚体(dodecamer)的晶体结构,是目前研究最广泛的B型DNA的一种形式,有关B型DNA结构特征的大量信息,都是从这个核苷酸十二聚体上得到的。 本文利用作者之一编制的分子力学程序即MODMIN程序,在太极计算机上,对序列为