基于生物信息学构建前列腺癌单细胞层面lncRNA-miRNA-mRNA调控网络

利用生物信息学筛选差异表达基因(Differentially Expressed Genes, DEGs),构建前列腺癌(Prostate Cancer, PCa)单细胞层面lncRNA-miRNA-mRNA调控网络,在分子水平上研究前列腺癌的发生发展过程及预后指标。首先从基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库分别下载单细胞RNA测序数据GSE157703和转录组测序数据TCGA-PRAD,通过R语言筛选差异表达信使RNA(DEmRNA)和差异表达长非编码RNA(DElncRNA),利用相关软件预测并构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络;然后使用R语言进行基因本体论(Gene Ontology, GO)和京都基因与基因百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)分析,运用STRING数据库、Cytoscape软件建立蛋白相互作用网络,同时对单细胞RNA测序数据进行质控、降维、聚类和分群,构建单细胞层面的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络;最后进行生存分析,通过人类蛋白质图谱进行验证。结果...     

间歇反应过程的智能控制系统

本文为间歇反应过程的智能控制系统提出了一种框架，对其中各部分作了详细分析。并由此抽象出来，为一般性的智能控制系统建立了基本概念和结构模型。     

Naja siamensis, a cryptic species of venomous snake revealed by mtDNA sequencing

Because of possible variation in venom composition, an understanding of venomous snake systematics is of great importance for the optimization of antivenom treatment of snakebite patients. Intraspecific variation in the morphology of many venomous snakes complicates the definition and indentification of some species when allopatric populations are involved. Selectively neutral or near-neutral mtDNA sequences can reveal evolutionary relationships obscured by ecogenetically-caused morphological variation. We use comparative sequencing of the cytochrome oxidase subunit 1 gene to reveal the existence of a widespread, cryptic species of spiting cobra from southeast Asia. This species,Naja siamensis, is widely sympatric with other Asiatic cobra species. This may be of considerable medical significance, and calls for further research into venom composition in Asiatic cobras.     

全国各地区城镇居民生活消费水平因子分析

对全国各地区城镇居民生活消费资料进行因子分析及综合评价、聚类。得出各地区城镇居民生活消费水平的排序。     

天花粉蛋白基因克隆、序列分析及在E.Coli中表达

天花粉蛋白为单链核糖体失活蛋白,具糖苷酶活性,对 HIV 和多种动植物病毒有明显的抑制作用,有广泛的理论价值和应用前景.本文在国内首次采用聚合酶链式反应(PCR)方法,以栝楼染色体 DNA 为模板、合成的寡聚核苷酸为引物,扩增出了编码成熟天花粉蛋白的 DNA 片段(称 gene 1)和编码含23个氨基酸组成的分泌型信号肽、成熟天花粉蛋白以及羧基端延伸因子在内的 DNA 片段(称 gene 2).两 DNA 片段已被组装于载体     

黑曲霉葡萄糖淀粉酶cDNA的克隆和序列分析及其在大肠杆菌中的表达(英文)

以poly(A)~ mRNA为模板,噬菌体λgt 10 DNA为载体构建了黑曲霉3758的cDNA的文库。用编码黑曲霉葡萄糖淀粉酶329—418位氨基酸的DNA顺序(456bp)作探针从该文库中筛选葡萄糖淀粉酶cDNA。采用原位噬菌斑杂交法获得11个阳性噬菌斑,从其中6个噬菌体中提取DNA进行限制酶切分析和印迹法转移杂交试验,发现这些阳性噬菌体DNA含有不同大小的插入片段,它们都能与DNA探针杂交,表明已克隆了葡萄糖淀粉酶的cDNA。采用单酶切及交叉双酶切法制定了2.1kbcDNA的物理图并对2.1kb片段作了全序列分析。序列分析结果显示,克隆的2.1kb片段含5＇端非编码区,编码葡萄糖淀粉酶的结构基因及3＇端非编码区。克隆的cDNA片段转移至表达载体λgt11,感染大肠杆菌后,产生的噬菌斑转移硝酸纤维素滤膜后与~(125)I标记的抗葡萄糖淀粉酶抗体进行免疫反应,结果证明含2.1kbcDNA的λgt11表现葡萄糖淀粉酶阳性.2.1kb片段也曾转至质粒pPL2,转化大肠杆菌JF1125。细胞裂解物在SDS-PAGE电泳中可看到新的蛋白带。这些结果表明,克隆的黑曲霉葡萄糖淀粉酶cDNA可以在大肠杆菌中表达。     

UASB处理石灰草浆黑液的流形分布(Ⅰ)

本文用KI作示踪剂,采用矩形脉冲示踪法测定了实验室规模的UASB反应器(有效容积27.5L)的流形分布。它表明UASB反应器可分为污泥床区、悬浮层区和三相分离区三部分。其中污泥床区和悬浮层区可用完全混和反应器描述;三相分离器可用管式反应器描述;污泥床区和悬浮层区通过废水流量和返混流量相连通。     

Paenibacillus Shenyangensis的DNA序列拼接与组装

在已有测序数据基础上,利用三种常见的序列组装软件对Paenibacillus Shenyangensis全基因组测序结果进行拼接组装,分析比较了不同软件在各自最优参数条件下DNA序列的组装数据,并与NCBI数据库中类芽孢杆菌属其他近缘种进行基因比对与预测.结果表明,SOAPdenovo的组装结果最优,在k-mer为23时,组装基因组总长和N50分别为5 501 467和293 864 bp,预测的4 800个基因中有4 393个与NCBI-Nr数据库比对并注释成功.     

通用试题库管理系统的设计

介绍了通用试题库管理系统的功能及试题库设计关键技术的解决.     

利用飞行时间质谱进行蛋白质和多肽C端序列测定

用羧肽酶Y水解蛋白质和多肽，结合飞行时间质谱（MALDI－TOF－MS）测定酶解后缩短肽的质量，根据相邻两肽峰的质量差别读出蛋白质和多肽的C端序列，在pmol水平下测定了人促肾上腺皮质激素片段以及人血管紧张肽片段，其中人促上腺皮质激素片段测到了C端15个氨基酸残基的顺序。