Protein functional-group 3D motif and its applications

Representing and recognizing protein active sites sequence motif (1D motif) and structural motif (3D motif) is an important topic for predicting and designing protein function. Prevalent methods for extracting and searching 3D motif always consider residue as the minimal unit, which have limited sensitivity. Here we present a new spatial representation of protein active sites, called "functional-group 3D motif ", based on the fact that the functional groups inside a residue contribute mostly to its function. Relevant algorithm and computer program are developed, which could be widely used in the function prediction and the study of structural-function relationship of proteins. As a test, we defined a functional-group 3D motif of the catalytic triad and oxyanion hole with the structure of porcine trypsin (PDB code: 1mct) as the template. With our motif-searching program, we successfully found similar sub-structures in trypsins, subtilisins and a/b hydrolases, which show distinct folds but share similar catalytic mechanism. Moreover, this motif can be used to elucidate the structural basis of other proteins with variant catalytic triads by comparing it to those proteins. Finally, we scanned this motif against a non-redundant protein structure database to find its matches, and the results demonstrated the potential application of functional group 3D motif in function prediction. Above all, compared with the other 3D-motif representations on residues, the functional group 3D motif achieves better representation of protein active region, which is more sensitive for protein function prediction.     

天津市发展现代远程教育的需求分析

以天津市人口发展趋势和天津市教育发展规划为基础 ,分析了天津市高等教育资源的现状 ,以及传统教育方式下的高等教育供求矛盾 ,并以供求缺口作为现代远程教育的需求 ,指出现代远程教育方式是实现天津市教育发展规划目标的有效手段 .     

事故树分析法在海事分析中的应用

在对事故树分析方法作了简单介绍的基础上,运用事故树分析法对一起海上事故进行分析,找出了导致事故的主要原因是船员未遵守《避碰规则》及运用良好的船艺.     

菲涅尔双棱镜干涉实验中凸透镜的选择

针对双棱镜干涉实验中大像难以观察到的情况,通过理论推导得出凸透镜焦距的界定范围。便于教师和仪器生产商选择合适的凸透镜。确保了实验的成功,完善了教材中关于凸透镜焦距的定义域。     

基于主被动结合防御的网络安全体系

介绍了网络安全防范中防火墙技术的局限性和蜜罐技术的特征,并设计出一种基于主被动结合防御的网络安全体系     

基于改进角点特征的多传感器图像配准

对模糊和有噪声干扰图像设计的高对比度角点提取算法进行了改进,将角点检测范围限定在高对比度“边缘带”,减少了角点检测范围,在保持角点检测精度的同时,算法效率提高了大约1倍.在点特征匹配阶段,采用归一化互相关初步建立点特征的对应关系,利用马氏距离仿射不变性筛选出正确点对,从而得到图像之间的仿射变换关系,实现图像的自动配准.实验结果证明了此算法的有效性和高效性.     

激光测距仪在海崖剖面形态快速测量中的应用

提出一种利用激光测距仪快速测量海崖及海蚀槽剖面形态的方法.选取福建省平潭岛东北部的7条海崖作为测量研究区,定时段进行崖面剖面形态的测量.结果表明:研究区中的4个海蚀槽均发育在距崖底1.0m高度范围内,且海蚀槽上部崖面的倾角大于下部崖面的倾角;一个断面的剖面测量只需7~16min,且能够测量人不易达到的区域.     

环F_q+uF_q+u~2F_q+…+u~(k-1)F_q上线性码的覆盖半径

文章研究了有限链环R=Fq+uFq+u2Fq+…+uk-1Fq上长为n的线性码关于齐次距离的覆盖半径,其中uk=0,q为某一素数幂。构造了环R上的广义Gray映射,得到了R上线性码关于覆盖半径的相关性质,并研究了环R上线性码覆盖半径的上下界。     

基于误差传递和熵的区间DEA方法

传统的DEA(data envelopment analysis)模型只能用来处理精确数据,而在现实生活中,由于统计误差、信息不完全等原因,获取精确数据十分困难,数据往往只能以区间数的形式给出.因此,如何在不确定条件下利用DEA方法评价决策单元的相对效率一直是DEA理论的研究前沿.针对这一问题,文章在DEA传统模型的基础上,利用改进的交叉效率思想,使用误差传递和熵处理区间数据,求得每个决策单元全局交叉效率的误差分布形式(中点值和误差最大估计值),然后根据全局交叉效率,使用有向距离指数给决策单元排序.最后通过两个算例来说明本文提出的方法的可行性和有效性.     

宏盛聚德煤业带压开采可行性分析

以山西柳林宏盛聚德煤业新开发矿区为工程背景,依托煤矿水文地质资料,采用脆弱性指数法和传统的突水系数法划分矿区4号煤的带压开采区域。结果表明:突水系数法只考虑个别因素,结果不够准确、带压开采区域分辨率低;脆弱性指数法考虑综合因素,结合矿区构造情况,所得结果较为全面。