南极深海底泥中产Ectoine中度嗜盐菌NJS-2的分离筛选及其性质研究

从南极深海底泥中分离到一株中度嗜盐菌NJS-2,经过16S rDNA(已提交GenBank,其登录号为DQ789389)序列分析、形态学和生理生化特征分析,该菌株初步鉴定为色盐杆菌属(Chromohalobacter).以其16S rDNA序列相似性为基础构建了包括8种相关种属在内的系统发育树.同源性分析表明,NJS-2与Chromohalobacter salexigens 的16S rDNA相似性达到99%以上,应归属于色盐杆菌属,命名该菌株为Chromohalobacter sp.NJS-2.研究了菌株NJS-2的相容性溶质四氢嘧啶(Ectoine)的累积及累积条件.研究发现,30℃条件下,在含2 mol/L NaCl的培养基中培养48 h,可最大诱导生成Ectoine 300 mg/L.反复渗透性休克试验表明:NJS-2在低渗条件下能够快速将细胞内的Ectoine分泌到细胞外,而在高渗环境中能够较快地重新合成.     

一株中度嗜盐菌Halomonas sp.NY-011的分离与鉴定

从盐生杜氏藻（Dunaliella salina）培养物内筛选到一株能在广泛NaCl浓度范围（0.5 %～21 %, w/v）和广泛pH值范围（pH 5～11）生长的嗜碱耐盐菌NY011.细胞形态电镜观察和生理生化分析表明, NY-011呈杆状,大小为（0.51～1.53）μm×（1.02～2.55）μm,革兰氏阴性,有荚膜,无鞭毛,不运动,好氧生长,淀粉水解酶呈阴性,接触酶呈阳性.其最适培养条件为：2% NaCl,30 ℃,起始pH值10.16S rDNA序列比对和构建的系统发育树表明该菌属于盐单胞菌     

昆虫病原线虫4新种所携带共生菌的分子鉴定

 以16S rDNA为分子标记对中山大学有害生物控制及资源利用国家重点实验室近年从我国采集到并描述发表的斯氏属昆虫病原线虫4个新种所携带的共生菌进行分类鉴定,结果显示Steinernema akhursti所携带的共生菌很可能是Xenorhabdus属的一个新种,S aciari和S. leizhouense所携带的共生菌可能是Xenorhabdus属的两个近缘的新种或同一种的两个远缘菌株,而S. beddingi所携带的共生菌可能是Xenorhabdus bovienii的一个新菌株。     

时事概览

2月19日,七国集团领导人举行视频会议,重点商讨新冠疫苗研发与分配、疫后经济振兴等议题。当天的视频会议由英国首相约翰逊主持。七国集团领导人在会后发表了联合声明,表示将“使2021年成为多边主义的转折之年”。在抗击疫情领域,七国集团表示将支持世卫组织发挥领导和协调作用;将加快全球疫苗开发和部署,与疫苗生产企业合作提高产量,加强对变异新冠病毒基因组测序等方面的信息共享等;重申支持“获得抗击新冠肺炎工具加速器”倡议,“新冠肺炎疫苗实施计划”,以及公平获得负担得起的疫苗、治疗和诊断。     

尾细桉生长和木材密度关联SNP挖掘与候选基因定位

【目的】生长和木材基本密度是桉树的重要经济性状,挖掘其候选功能基因可为桉树遗传改良提供参考。【方法】以尾叶桉(Eucalyptus urophylla)和细叶桉(Eucalyptus tereticornis) F1全同胞子代试验林为研究对象,测定其8年生树高、胸径和木材基本密度,开展表型遗传分析。筛选极端表型个体,利用测序分型(GBS)开发SNP标记进行关联分析。挖掘与树高、胸径和木材基本密度关联的SNP位点,并进行候选基因初步定位。【结果】尾细桉F1子代树高、胸径与木材基本密度间的表型变异系数为7.51%~26.19%,生长性状与木材基本密度显著正相关。利用GBS获得了覆盖全基因组的15 185个SNP位点,关联分析共鉴定111个与生长和木材基本密度显著关联的SNP,其中2号染色体上检测到强烈的生长性状关联信号。定位40个与生长和木材基本密度相关候选基因,共富集在52个GO terms,基因功能注释分析表明其功能主要与植物抗逆性、生物与非生物胁迫、转录因子家族等相关。【结论】本研究获得了一批与尾细桉生长和材性性状关联的SNP位点和候选基因,并进行了树高、胸径及木材基本密度候选基因初步定位,挖掘的与抗逆性相关的基因可能在树木的生长和木材形成中发挥重要作用。     

心房颤动伴脑卒中患者循环lncRNAs表达谱的初步研究

利用高通量测序筛选心房颤动(房颤)伴脑卒中患者外周血单核细胞中差异表达的lncRNAs,为从分子水平探讨房颤脑卒中发生发展机制提供实验依据,并寻找预测房颤脑卒中相关生物学标志物.应用高通量测序检测三例房颤伴脑卒中患者和三例房颤患者外周血单核细胞lncRNAs差异表达,进行基因本体论(Gene Ontology,GO)、...     

自然水体生物膜中真菌结构与组成特征初步研究

为深入了解自然水体生物膜中真菌结构和组成特征,本研究以松花江水体生物膜为例,利用高通量测序技术对自然水体生物膜中的真菌ITS1基因进行了序列测试与分析,研究自然水体生物膜中真菌的多样性和组成特征。研究结果表明：(1)生物膜中真菌分属于8个门、20个纲、39个目、59个科和61个属。(2)真菌优势门为结合菌门,丰度约为43.23 ± 0.88 %,次优势菌门为担子菌门和聚合菌门,丰度分别约为13.70 ± 2.88 %和9.90 ± 2.83 %;优势属为蛙粪霉属,丰度为36.26 ± 9.07 %。     

水稻低温胁迫响应microRNA鉴定

水稻是世界三大粮食作物之一,然而低温胁迫会严重抑制水稻的生长发育.为了探究microRNA在水稻低温胁迫中的作用,采用低温处理前、5℃低温处理24 h和5℃低温处理48 h的2～3叶期水稻整株,构建9个小RNA文库.通过高通量测序后,对9个小RNA文库的microRNA进行差异表达分析,一共筛选出21个与冷胁迫相关的m...     

科学家发现新型果蝇基因测序方法

由于果蝇的基因可以被人工插入、删除或修改，可以被随机突变为人们所感兴趣的人类疾病特性以供研究，所以果蝇经常被用于对普通生物过程和人类疾病的研究。但是要从大量的果蝇基因中寻找出带有研究人员所感兴趣的特定的突变基因却可谓是一件旷日持久的浩大工程，并且还有不少突变所导致的相关疾病还尚未被发现。     

三峡库区消落带3种人工种植植物土壤理化性质、酶活性及细菌多样性季节变化特征

为探究三峡库区消落带3种人工种植植物狗牙根(Cynodon dactylon)、牛鞭草(Hemarthria altissima)和旱柳(Salix matsudana)土壤理化性质、酶活性及细菌群落的季节变化特征，在2020年春、夏、秋季节于重庆市忠县汝溪河流域3种植物的栽植地共采集了27个混合土壤样本并进行了有关指标的分析。结果显示：1) 3种植物土壤有机质、铵态氮、硝态氮的质量分数等指标在不同季节间存在差异；除牛鞭草土壤中的蔗糖酶以外，其余土壤样本的酶活性均在春季最高。2) 各土壤样本中细菌在门、纲层次上的相对丰度都存在一定的季节差异；除Simpson指数以外，牛鞭草、旱柳土壤细菌各项α多样性指数均在夏季最低。3) 通过冗余分析可知，影响3种植物土壤细菌群落结构的土壤理化因子主要有pH和硝态氮、全氮的质量分数。上述研究结果揭示了消落带人工修复植物土壤细菌群落的季节变化规律，为三峡库区消落带的植被修复提供了一定的理论依据。